MirGeneDB ID | Bge-Mir-92-P3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-92 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Cockroach (Blattella germanica) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Bge-Mir-92-P4 Bge-Mir-92-P14 Bge-Mir-92-P15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aae-Mir-92-P3 Aga-Mir-92-P3 Asu-Mir-92 Bfl-Mir-92-o3 Bla-Mir-92-o3 Cel-Mir-92 Dan-Mir-92-P3 Dlo-Mir-92-P3 Dma-Mir-92-P3 Dme-Mir-92-P3 Dmo-Mir-92-P3 Dpu-Mir-92-P3 Dsi-Mir-92-P3 Dya-Mir-92-P3 Esc-Mir-92 Gpa-Mir-92-P3 Gsp-Mir-92 Hme-Mir-92-P3 Hmi-Mir-92 Isc-Mir-92 Obi-Mir-92 Sme-Mir-92 Tca-Mir-92-P3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Pancrustacea | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Bger_2.0) |
KZ615620.1: 336862-336921 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-92-P3) |
Mir-92-P3
KZ615620.1: 336862-336921 [+]
Ensembl
Mir-92-P4 KZ615620.1: 336987-337043 [+] Ensembl |
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Seed | GUCCGUG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AGUCGGAGAUUCACAAAUGCAGUCGUGGUCAGUCCGUGACUUGUGGCAAUAUUAUCAUUGUAUACAAAUAUUGCACUUGUCCCGGCCUAUCCAAGGCAGUACUUCGACGGCGUGGAUCUCGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 AGUCGGAGAUUCACAAA--| A G UC U U UU G AUCAUU UGC GUC UGG AG CCG GAC GUG CAAUAUU \ AUG CGG ACC UC GGC CUG CAC GUUAUAA G CUCUAGGUGCGGCAGCUUC^ A A UA C C UU - ACAUAU . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Bge-Mir-92-P3_5p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AGUCCGUGACUUGUGGCAAUAUU -23
Get sequence
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Co-mature sequence | Bge-Mir-92-P3_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
38- UAUUGCACUUGUCCCGGCCUAU -60
Get sequence
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