MirGeneDB ID | Dme-Mir-92-P3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-92 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AUUGCAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Fruit fly (Drosophila melanogaster) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | dme-mir-92a | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Dme-Mir-92-P4 Dme-Mir-92-P5 Dme-Mir-92-P6 Dme-Mir-92-P7 Dme-Mir-92-P8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Asu-Mir-92 Bfl-Mir-92-o3 Bla-Mir-92-o3 Cel-Mir-92 Dan-Mir-92-P3 Dmo-Mir-92-P3 Dsi-Mir-92-P3 Dya-Mir-92-P3 Esc-Mir-92 Isc-Mir-92 Obi-Mir-92 Sme-Mir-92 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Drosophila | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Drosophila_melanogaster_BDGP6) |
3R: 25646522-25646581 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-92-P3) |
Mir-92-P3
3R: 25646522-25646581 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-92-P4 3R: 25651416-25651478 [+] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UUCAGCCGAAUAUAAAUAUGAAUUUCCCGUAGGACGGGAAGGUGUCAACGUUUUGCAUUUCGAAUAAACAUUGCACUUGUCCCGGCCUAUGGGCGGUUUGUAAUAAACAACUAAAAUCUAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 UUCAGCCGAAUAUAAAU-- UG UU A -| U C UUGCAU A AAU CCCGUAGG CGGGA AGGUG CAA GUU U U UUG GGGUAUCC GCCCU UUCAC GUU CAA U AUCUAAAAUCAACAAAUAA GU GC G G^ - A AUAAGC . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Dme-Mir-92-P3_5p* |
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mirBase accession | MIMAT0020802 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AGGACGGGAAGGUGUCAACGUU -22
Get sequence
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Mature sequence | Dme-Mir-92-P3_3p |
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mirBase accession | MIMAT0000334 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
38- CAUUGCACUUGUCCCGGCCUAU -60
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000334 TargetScanFly: dme-miR-92a |