MirGeneDB ID | Bge-Mir-92-P15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-92 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Cockroach (Blattella germanica) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Bge-Mir-92-P3 Bge-Mir-92-P4 Bge-Mir-92-P14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Asu-Mir-92 Cel-Mir-92 Esc-Mir-92 Gsp-Mir-92 Hmi-Mir-92 Isc-Mir-92 Obi-Mir-92 Sme-Mir-92 Spu-Mir-92-o15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | B. germanica | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Bger_2.0) |
KZ614500.1: 94957-95013 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-92-P15) |
Novel-9-P1
KZ614500.1: 80393-80452 [+]
Ensembl
Novel-9-P2 KZ614500.1: 82175-82234 [+] Ensembl Novel-10-P1 KZ614500.1: 92245-92301 [+] Ensembl Novel-10-P2 KZ614500.1: 92716-92772 [+] Ensembl Mir-92-P15 KZ614500.1: 94957-95013 [+] Ensembl Novel-11 KZ614500.1: 96730-96787 [+] Ensembl |
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Seed | AUUGCAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AAAACGGAAUGGAUAUCACUGGUUCCUUUCAGGAUAUGACAUUUGCAAAUUUUGUGAUUUAAAAAAUUGCACUUGUUAUAUUCUUGAAAGCACCAGAGUAGCACCAAGAUGUCCUUAGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 AAAACGGAAUGGAUAUCA---| UC - UU A UGUG CUGGU CUUUCAGGA UAUGACA UGCAA UUU A GACCA GAAAGUUCU AUAUUGU ACGUU AAA U AUUCCUGUAGAACCACGAUGA^ C- U UC A AAUU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Bge-Mir-92-P15_5p* |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AGGAUAUGACAUUUGCAAAUUU -22
Get sequence
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Mature sequence | Bge-Mir-92-P15_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
34- AAUUGCACUUGUUAUAUUCUUGA -57
Get sequence
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