| MirGeneDB ID | Mmr-Mir-361 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-361 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Gray mouse lemur (Microcebus murinus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmr-mir-361 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-361-v1 Cfa-Mir-361-v1 Cja-Mir-361-v1 Cpo-Mir-361-v1 Dno-Mir-361-v1 Eca-Mir-361-v1 Ete-Mir-361-v1 Hsa-Mir-361-v1 Laf-Mir-361 Mml-Mir-361-v1 Mmu-Mir-361-v1 Ocu-Mir-361-v1 Pab-Mir-361-v1 Rno-Mir-361-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_000165445.3_Mmur_3.0_genomic) |
CM007693.1: 15153981-15154043 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-361-v1) |
Mir-361-v1
CM007693.1: 15153981-15154043 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-361-v2 CM007693.1: 15153982-15154042 [-] UCSC Ensembl |
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| Variant | Mmr-Mir-361-v1 |
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| Seed | UAUCAGA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GGAAGUGAUUCUUUCCUGGGAUUUGGGAGCUUAUCAGAAUCUCCAGGGGUACUUAUAAUUUGAAAAAGUCCCCCAGGUGUGAUUCUGAUUUGCUUCCUUCUCCUCCUCCUCCUUUGAAAAUCAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 GGAAGUGAUUCUUUCCU-- UUU UU U--| A U UUAUAAU GGGA GGGAGC AUCAGAAUC CC GGGG AC \ UCCU CCUUCG UAGUCUUAG GG CCCC UG U ACUAAAAGUUUCCUCCUCC CUU UU UGU^ A C AAAAAGU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mmr-Mir-361-v1_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0049172 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UUAUCAGAAUCUCCAGGGGUAC -22
Get sequence
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| Co-mature sequence | Mmr-Mir-361-v1_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- CCCCCAGGUGUGAUUCUGAUUUGC -63
Get sequence
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| Variant | Mmr-Mir-361-v2 |
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| Seed | CCCCCAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GAAGUGAUUCUUUCCUGGGAUUUGGGAGCUUAUCAGAAUCUCCAGGGGUACUUAUAAUUUGAAAAAGUCCCCCAGGUGUGAUUCUGAUUUGCUUCCUUCUCCUCCUCCUCCUUUGAAAAUCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 GAAGUGAUUCUUUCCUG-- UUU UU U--| A U UAUAAU GGA GGGAGC AUCAGAAUC CC GGGG ACU \ CCU CCUUCG UAGUCUUAG GG CCCC UGA U CUAAAAGUUUCCUCCUCCU CUU UU UGU^ A C AAAAGU . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| Comment | The mature form of this variant is most highly expressed as a 2 nt shorter form but is rarely accompanied by a 19 nt corresponding 5p star read. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Mmr-Mir-361-v2_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0049172 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UAUCAGAAUCUCCAGGGGUACU -22
Get sequence
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| Mature sequence | Mmr-Mir-361-v2_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- UCCCCCAGGUGUGAUUCUGAUUUG -61
Get sequence
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