| MirGeneDB ID | Mml-Mir-506-P3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-506 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Rhesus monkey (Macaca mulatta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mml-mir-508 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Mml-Mir-506-P1a Mml-Mir-506-P1b Mml-Mir-506-P1c4 Mml-Mir-506-P1c5 Mml-Mir-506-P1c6 Mml-Mir-506-P1d Mml-Mir-506-P1e Mml-Mir-506-P2b Mml-Mir-506-P4 Mml-Mir-506-P5o1 Mml-Mir-506-P5o2 Mml-Mir-506-P5o3 Mml-Mir-506-P5o4a Mml-Mir-506-P5o4b Mml-Mir-506-P6a Mml-Mir-506-P6b Mml-Mir-506-P6c Mml-Mir-506-P6d Mml-Mir-506-P6e | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-506-P3 Cfa-Mir-506-P3a Cfa-Mir-506-P3b Cja-Mir-506-P3 Dno-Mir-506-P3 Eca-Mir-506-P3 Hsa-Mir-506-P3 Laf-Mir-506 Mmr-Mir-506-P3 Ocu-Mir-506-P3 Pab-Mir-506-P3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_003339765.3_Mmul_10_traces) |
CM014356.1: 143281565-143281622 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-506-P3) |
Mir-506-P5o4a
CM014356.1: 143232188-143232245 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-506-P5o4b CM014356.1: 143239333-143239390 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P5o3 CM014356.1: 143252920-143252977 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P5o2 CM014356.1: 143261882-143261939 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P5o1 CM014356.1: 143270447-143270504 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P4 CM014356.1: 143275369-143275425 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P2b CM014356.1: 143275695-143275752 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P3 CM014356.1: 143281565-143281622 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P1e CM014356.1: 143285603-143285660 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P1d CM014356.1: 143290733-143290793 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P1c5 CM014356.1: 143294073-143294130 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P1c4 CM014356.1: 143294958-143295015 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P1b CM014356.1: 143303098-143303155 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P1a CM014356.1: 143309725-143309782 [-] UCSC Ensembl |
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| Seed | UUGUCGC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AGUCACCAUCUUCAGCUGAGUGUCGUGCUCUACUCCAGAGGGCGUCACUCACAUAAACUAAAACAUGAUUGUCGCCUUUUUGAGUAGAGUAAUACACAUCACGUAAGGCAUAUUUGGUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 AGUCACCAUCUUCAGCU- -| CG C U C CAUAAA GA GUGU UGCUCUACUC AGAGGGCG CA UCA C CU CACA AUGAGAUGAG UUUUCCGC GU AGU U UGGUUUAUACGGAAUGCA A^ UA U U U ACAAAA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| Comment | The Dicer cut is shifted -2 relative to human. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Mml-Mir-506-P3_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0026746 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UACUCCAGAGGGCGUCACUCA -21
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-508-5p |
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| Mature sequence | Mml-Mir-506-P3_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0005764 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- AUUGUCGCCUUUUUGAGUAGA -58
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-508-3p |
