| MirGeneDB ID | Mml-Mir-506-P6c | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-506 (all species) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Rhesus monkey (Macaca mulatta) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mml-mir-888 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Mml-Mir-506-P1a Mml-Mir-506-P1b Mml-Mir-506-P1c4 Mml-Mir-506-P1c5 Mml-Mir-506-P1c6 Mml-Mir-506-P1d Mml-Mir-506-P1e Mml-Mir-506-P2b Mml-Mir-506-P3 Mml-Mir-506-P4 Mml-Mir-506-P5o1 Mml-Mir-506-P5o2 Mml-Mir-506-P5o3 Mml-Mir-506-P5o4a Mml-Mir-506-P5o4b Mml-Mir-506-P6a Mml-Mir-506-P6b Mml-Mir-506-P6d Mml-Mir-506-P6e | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Cja-Mir-506-P6c Hsa-Mir-506-P6c Laf-Mir-506 Pab-Mir-506-P6c | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Simiiformes | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_003339765.3_Mmul_10_traces) |
CM014356.1: 142033498-142033554 [-] UCSC Ensembl | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-506-P6c) |
Mir-506-P6e
CM014356.1: 142031479-142031535 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-506-P6d CM014356.1: 142032972-142033028 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P6c CM014356.1: 142033498-142033554 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P6b CM014356.1: 142035052-142035108 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P6a CM014356.1: 142035582-142035638 [-] UCSC Ensembl |
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| Seed | ACUCAAA | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CCACAAUUAGCCAUGUCGUGGGCAGUGCCCUACUCAAAAAGCUGUCAGUCACUUAUGUUACAUGUGACUGACACCUCUUUAGAUGAAGGAAGGCUCAUCAAGUACAGUUUUGUGGUGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CCACAAUUAGCCAUGUC--| AGUG CUAC - A C UUAUG GUGGGC CC UC AAA AG UGUCAGUCAC \ UACUCG GG AG UUU UC ACAGUCAGUG U GUGGUGUUUUGACAUGAAC^ GAA- AAGU A C C UACAU 110 100 90 80 70 60 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | Unknown | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mml-Mir-506-P6c_5p (predicted) |
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| mirBase accession | MIMAT0006527 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UACUCAAAAAGCUGUCAGUCAC -22
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-888 |
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| Star sequence | Mml-Mir-506-P6c_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
35- GACUGACACCUCUUUAGAUGAA -57
Get sequence
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