MirGeneDB ID | Mml-Mir-430-P6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-430 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AAGUGCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Rhesus monkey (Macaca mulatta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | mml-mir-372 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Mml-Mir-430-P1 Mml-Mir-430-P2 Mml-Mir-430-P3 Mml-Mir-430-P4 Mml-Mir-430-P5 Mml-Mir-430-P7 Mml-Mir-430-P8 Mml-Mir-430-P9c Mml-Mir-430-P9d Mml-Mir-430-P9e Mml-Mir-430-P10 Mml-Mir-430-P11a Mml-Mir-430-P11b Mml-Mir-430-P12 Mml-Mir-430-P13a1 Mml-Mir-430-P13a2 Mml-Mir-430-P13b Mml-Mir-430-P13c Mml-Mir-430-P14 Mml-Mir-430-P18 Mml-Mir-430-P19 Mml-Mir-430-P21 Mml-Mir-430-P24a1 Mml-Mir-430-P24a2 Mml-Mir-430-P24b Mml-Mir-430-P26a Mml-Mir-430-P26b Mml-Mir-430-P27 Mml-Mir-430-P28 Mml-Mir-430-P29c Mml-Mir-430-P29d Mml-Mir-430-P31c Mml-Mir-430-P31d Mml-Mir-430-P33 Mml-Mir-430-P35d Mml-Mir-430-P35e Mml-Mir-430-P35f-v1 Mml-Mir-430-P35f-v2 Mml-Mir-430-P37 Mml-Mir-430-P41 Mml-Mir-430-P42 Mml-Mir-430-P43 Mml-Mir-430-P44 Mml-Mir-430-P45 Mml-Mir-430-P47 Mml-Mir-430-P49 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Dno-Mir-430-P6 Hsa-Mir-430-P6 Mmu-Mir-430-P6 Rno-Mir-430-P6a Rno-Mir-430-P6b Xla-Mir-430-o6a Xla-Mir-430-o6b Xtr-Mir-430-o6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (rheMac8_trace) |
chr19: 49142282-49142340 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-430-P6) |
Mir-430-P24a1
chr19: 49092996-49093055 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-430-P35e chr19: 49094969-49095027 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P37 chr19: 49102341-49102401 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P29c chr19: 49104035-49104095 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P41 chr19: 49105608-49105667 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P24b chr19: 49108097-49108156 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P31d chr19: 49109643-49109704 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P31c chr19: 49114300-49114361 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P5 chr19: 49142073-49142134 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P6 chr19: 49142282-49142340 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P7 chr19: 49142989-49143049 [+] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UCUUGCAGGUAGAGCUGCUCACCCUGUGAUCCUCAAAUGUGGAGCACUAUUCUGAUGUCCAAGUGGAAAGUGCUGCGACAUUUGAGCGUCACCGGUGACGCCCAUACCAACGGAUGCCGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 UCUUGCAGGUAGAGCUGC---| CU C - G A GAUGU UCACC GUGAU CUCAAAUGU G AGCACU UUCU \ AGUGG CACUG GAGUUUACA C UCGUGA AAGG C GCCGUAGGCAACCAUACCCGC^ C- C G G - UGAAC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Mml-Mir-430-P6_5p* |
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mirBase accession | MIMAT0026858 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CCUCAAAUGUGGAGCACUAUUCU -23
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-372-5p |
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Mature sequence | Mml-Mir-430-P6_3p |
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mirBase accession | MIMAT0006298 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
36- AAAGUGCUGCGACAUUUGAGCGU -59
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-372-3p |