| MirGeneDB ID | Mml-Mir-430-P6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Family name | MIR-430 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Rhesus monkey (Macaca mulatta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mml-mir-372 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Mml-Mir-430-P1 Mml-Mir-430-P2 Mml-Mir-430-P3 Mml-Mir-430-P4 Mml-Mir-430-P5 Mml-Mir-430-P7 Mml-Mir-430-P8 Mml-Mir-430-P9 Mml-Mir-430-P10 Mml-Mir-430-P12c Mml-Mir-430-P12d Mml-Mir-430-P12e Mml-Mir-430-P14a Mml-Mir-430-P14b Mml-Mir-430-P15 Mml-Mir-430-P16 Mml-Mir-430-P17 Mml-Mir-430-P18 Mml-Mir-430-P20 Mml-Mir-430-P21 Mml-Mir-430-P22 Mml-Mir-430-P24 Mml-Mir-430-P25 Mml-Mir-430-P27a Mml-Mir-430-P27b Mml-Mir-430-P28 Mml-Mir-430-P29a Mml-Mir-430-P29b-v1 Mml-Mir-430-P29c Mml-Mir-430-P30 Mml-Mir-430-P31 Mml-Mir-430-P32a1 Mml-Mir-430-P32a2 Mml-Mir-430-P32b Mml-Mir-430-P33 Mml-Mir-430-P34 Mml-Mir-430-P36a1 Mml-Mir-430-P36a2 Mml-Mir-430-P36b Mml-Mir-430-P36c Mml-Mir-430-P38 Mml-Mir-430-P39 Mml-Mir-430-P42 Mml-Mir-430-P43 Mml-Mir-430-P44 Mml-Mir-430-P45a Mml-Mir-430-P45b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Cja-Mir-430-P6 Dno-Mir-430-P6 Eca-Mir-430-P6 Hsa-Mir-430-P6 Mmr-Mir-430-P6 Mmu-Mir-430-P6 Pab-Mir-430-P6 Rno-Mir-430-P6a Rno-Mir-430-P6b Xla-Mir-430-o6a Xla-Mir-430-o6b Xtr-Mir-430-o6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_003339765.3_Mmul_10_traces) |
CM014354.1: 53555552-53555610 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-430-P6) |
Mir-430-P32a2
CM014354.1: 53507505-53507564 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-430-P29c CM014354.1: 53509478-53509536 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P33 CM014354.1: 53510678-53510743 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P44 CM014354.1: 53516856-53516916 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P31 CM014354.1: 53518551-53518611 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P39 CM014354.1: 53520125-53520184 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P32b CM014354.1: 53522610-53522669 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P45a CM014354.1: 53524156-53524217 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P27b CM014354.1: 53525794-53525853 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P45b CM014354.1: 53528832-53528893 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P5 CM014354.1: 53555343-53555404 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P6 CM014354.1: 53555552-53555610 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P7 CM014354.1: 53556259-53556319 [+] UCSC Ensembl |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AAGUGCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UCUUGCAGGUAGAGCUGCUCACCCUGUGAUCCUCAAAUGUGGAGCACUAUUCUGAUGUCCAAGUGGAAAGUGCUGCGACAUUUGAGCGUCACCGGUGACGCCCAUACCAACGGAUGCCGGet precursor sequence |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 UCUUGCAGGUAGAGCUGC---| CU C - G A GAUGU UCACC GUGAU CUCAAAUGU G AGCACU UUCU \ AGUGG CACUG GAGUUUACA C UCGUGA AAGG C GCCGUAGGCAACCAUACCCGC^ C- C G G - UGAAC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Star sequence | Mml-Mir-430-P6_5p* |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| mirBase accession | MIMAT0026858 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CCUCAAAUGUGGAGCACUAUUCU -23
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-372-5p |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mature sequence | Mml-Mir-430-P6_3p |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| mirBase accession | MIMAT0006298 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
36- AAAGUGCUGCGACAUUUGAGCGU -59
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-372-3p |
