| MirGeneDB ID | Mml-Mir-430-P21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-430 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AAGUGCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Rhesus monkey (Macaca mulatta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mml-mir-520a | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Mml-Mir-430-P1 Mml-Mir-430-P2 Mml-Mir-430-P3 Mml-Mir-430-P4 Mml-Mir-430-P5 Mml-Mir-430-P6 Mml-Mir-430-P7 Mml-Mir-430-P8 Mml-Mir-430-P9c Mml-Mir-430-P9d Mml-Mir-430-P9e Mml-Mir-430-P10 Mml-Mir-430-P11a Mml-Mir-430-P11b Mml-Mir-430-P12 Mml-Mir-430-P13a1 Mml-Mir-430-P13a2 Mml-Mir-430-P13b Mml-Mir-430-P13c Mml-Mir-430-P14 Mml-Mir-430-P18 Mml-Mir-430-P19 Mml-Mir-430-P24a1 Mml-Mir-430-P24a2 Mml-Mir-430-P24b Mml-Mir-430-P26a Mml-Mir-430-P26b Mml-Mir-430-P27 Mml-Mir-430-P28 Mml-Mir-430-P29c Mml-Mir-430-P29d Mml-Mir-430-P31c Mml-Mir-430-P31d Mml-Mir-430-P33 Mml-Mir-430-P35d Mml-Mir-430-P35e Mml-Mir-430-P35f-v1 Mml-Mir-430-P35f-v2 Mml-Mir-430-P37 Mml-Mir-430-P41 Mml-Mir-430-P42 Mml-Mir-430-P43 Mml-Mir-430-P44 Mml-Mir-430-P45 Mml-Mir-430-P47 Mml-Mir-430-P49 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Hsa-Mir-430-P21 Sha-Mir-430-o21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Catarrhini | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (rheMac8_trace) |
chr19: 49034618-49034677 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-430-P21) |
Mir-430-P8
chr19: 49015081-49015138 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-1323 chr19: 49019644-49019699 [+] UCSC Ensembl Mir-498 chr19: 49021712-49021771 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P9c chr19: 49028325-49028387 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P28 chr19: 49030126-49030186 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P21 chr19: 49034618-49034677 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P47 chr19: 49038964-49039022 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P18 chr19: 49039776-49039836 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P44 chr19: 49042159-49042219 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P42 chr19: 49043006-49043064 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P14 chr19: 49044975-49045033 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P26b chr19: 49046148-49046208 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P10 chr19: 49048508-49048566 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P26a chr19: 49053892-49053952 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P11a chr19: 49056095-49056153 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P43 chr19: 49057961-49058020 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P35d chr19: 49059976-49060036 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P19 chr19: 49061125-49061189 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P24a2 chr19: 49066431-49066490 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P27 chr19: 49068476-49068541 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P13a2 chr19: 49073256-49073314 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P13b chr19: 49075909-49075967 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P13a1 chr19: 49077769-49077827 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P13c chr19: 49080363-49080424 [+] UCSC Ensembl |
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| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GCUGGAGCCAGAAGAUCUCAGGCUGUGACCCUCCAGAGGGAAGUAUUUUCUGUUGUCUGAAGGAAAAGAAAGUGCUUCCCUUUGGACUGUUUCGGUUUGAGAAAAGCAACAUUGCAGUUGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 GCUGGAGCCAGAAGAUC---| U CC GUUGUCU UCAGGCUG GAC UCCAGAGGGAAGUAUUUUCU \ AGUUUGGC UUG AGGUUUCCCUUCGUGAAAGA G GUUGACGUUACAACGAAAAG^ U UC AAAGGAA . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Mml-Mir-430-P21_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0026896 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CUCCAGAGGGAAGUAUUUUCU -21
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-520a-5p |
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| Mature sequence | Mml-Mir-430-P21_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0006388 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
38- AAAGUGCUUCCCUUUGGACUGU -60
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-520a-3p |
