| MirGeneDB ID | Mml-Mir-430-P29c | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-430 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | ACGCACU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Rhesus monkey (Macaca mulatta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mml-mir-521 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Mml-Mir-430-P1 Mml-Mir-430-P2 Mml-Mir-430-P3 Mml-Mir-430-P4 Mml-Mir-430-P5 Mml-Mir-430-P6 Mml-Mir-430-P7 Mml-Mir-430-P8 Mml-Mir-430-P9c Mml-Mir-430-P9d Mml-Mir-430-P9e Mml-Mir-430-P10 Mml-Mir-430-P11a Mml-Mir-430-P11b Mml-Mir-430-P12 Mml-Mir-430-P13a1 Mml-Mir-430-P13a2 Mml-Mir-430-P13b Mml-Mir-430-P13c Mml-Mir-430-P14 Mml-Mir-430-P18 Mml-Mir-430-P19 Mml-Mir-430-P21 Mml-Mir-430-P24a1 Mml-Mir-430-P24a2 Mml-Mir-430-P24b Mml-Mir-430-P26a Mml-Mir-430-P26b Mml-Mir-430-P27 Mml-Mir-430-P28 Mml-Mir-430-P29d Mml-Mir-430-P31c Mml-Mir-430-P31d Mml-Mir-430-P33 Mml-Mir-430-P35d Mml-Mir-430-P35e Mml-Mir-430-P35f-v1 Mml-Mir-430-P35f-v2 Mml-Mir-430-P37 Mml-Mir-430-P41 Mml-Mir-430-P42 Mml-Mir-430-P43 Mml-Mir-430-P44 Mml-Mir-430-P45 Mml-Mir-430-P47 Mml-Mir-430-P49 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Sha-Mir-430-o29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | M. mulatta | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (rheMac8_trace) |
chr19: 49104035-49104095 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-430-P29c) |
Mir-430-P11a
chr19: 49056095-49056153 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-430-P43 chr19: 49057961-49058020 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P35d chr19: 49059976-49060036 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P19 chr19: 49061125-49061189 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P24a2 chr19: 49066431-49066490 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P27 chr19: 49068476-49068541 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P13a2 chr19: 49073256-49073314 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P13b chr19: 49075909-49075967 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P13a1 chr19: 49077769-49077827 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P13c chr19: 49080363-49080424 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P33 chr19: 49089851-49089913 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P24a1 chr19: 49092996-49093055 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P35e chr19: 49094969-49095027 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P37 chr19: 49102341-49102401 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P29c chr19: 49104035-49104095 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P41 chr19: 49105608-49105667 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P24b chr19: 49108097-49108156 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P31d chr19: 49109643-49109704 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P31c chr19: 49114300-49114361 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P5 chr19: 49142073-49142134 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P6 chr19: 49142282-49142340 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P7 chr19: 49142989-49143049 [+] UCSC Ensembl |
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| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CGCUGGAGCAAGAAGAUCUCAUGCUGUGACCCUCCAAAGGGAAGUACUUUCUGUUGUCUAAAAGAAAAGAACGCACUUCCCUUUGGAGUGUUACCGUUUGAGAAAAGCAACGUUGAAGUUGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 CGCUGGAGCAAGAAGAU--| U U C ACU GUUGUCU CUCA GC GUGAC CUCCAAAGGGAAGU UUCU \ GAGU UG CAUUG GAGGUUUCCCUUCA AAGA A GUUGAAGUUGCAACGAAAA^ U C U CGC AAAGAAA . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Mml-Mir-430-P29c_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CCUCCAAAGGGAAGUACUUUCU -22
Get sequence
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| Mature sequence | Mml-Mir-430-P29c_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0006397 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- AACGCACUUCCCUUUGGAGUGU -61
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-521 |
