MirGeneDB ID | Mml-Mir-430-P25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Family name | MIR-430 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Rhesus monkey (Macaca mulatta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Mml-Mir-430-P1 Mml-Mir-430-P2 Mml-Mir-430-P3 Mml-Mir-430-P4 Mml-Mir-430-P5 Mml-Mir-430-P6 Mml-Mir-430-P7 Mml-Mir-430-P8 Mml-Mir-430-P9 Mml-Mir-430-P10 Mml-Mir-430-P12c Mml-Mir-430-P12d Mml-Mir-430-P12e Mml-Mir-430-P14a Mml-Mir-430-P14b Mml-Mir-430-P15 Mml-Mir-430-P16 Mml-Mir-430-P17 Mml-Mir-430-P18 Mml-Mir-430-P20 Mml-Mir-430-P21 Mml-Mir-430-P22 Mml-Mir-430-P24 Mml-Mir-430-P27a Mml-Mir-430-P27b Mml-Mir-430-P28 Mml-Mir-430-P29a Mml-Mir-430-P29b-v1 Mml-Mir-430-P29c Mml-Mir-430-P30 Mml-Mir-430-P31 Mml-Mir-430-P32a1 Mml-Mir-430-P32a2 Mml-Mir-430-P32b Mml-Mir-430-P33 Mml-Mir-430-P34 Mml-Mir-430-P36a1 Mml-Mir-430-P36a2 Mml-Mir-430-P36b Mml-Mir-430-P36c Mml-Mir-430-P38 Mml-Mir-430-P39 Mml-Mir-430-P42 Mml-Mir-430-P43 Mml-Mir-430-P44 Mml-Mir-430-P45a Mml-Mir-430-P45b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Hsa-Mir-430-P25 Sha-Mir-430-o25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Catarrhini | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_003339765.3_Mmul_10_traces) |
ref|NC_027911.1|:49052010-49052273: 102-160 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UCUAGAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GCUGGAGCAAGAAGAGCUCAGGCUGUGACCGUCUAGAGGGAAGCACUUUCUGUUGCUUGAAAGAAGGGAAAGCGCUUCCUUUUAGAGGAUUACUCUUUGAGAAAAGCCAUGUUGAGGUUGet precursor sequence |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 GCUGGAGCAAGAAGAGC-- CU -| G A GUUGCUU UCAGG GUGA CC UCUAGAGGGAAGC CUUUCU \ AGUUU CAUU GG AGAUUUUCCUUCG GAAAGG G UUGGAGUUGUACCGAAAAG CU A^ - C GAAGAAA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mature sequence | Mml-Mir-430-P25_5p |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- GUCUAGAGGGAAGCACUUUCUG -22
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Star sequence | Mml-Mir-430-P25_3p* |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
37- GAAAGCGCUUCCUUUUAGAGGA -59
Get sequence
|