| MirGeneDB ID | Mml-Mir-430-P36a1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-430 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Rhesus monkey (Macaca mulatta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mml-mir-518d-2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Mml-Mir-430-P1 Mml-Mir-430-P2 Mml-Mir-430-P3 Mml-Mir-430-P4 Mml-Mir-430-P5 Mml-Mir-430-P6 Mml-Mir-430-P7 Mml-Mir-430-P8 Mml-Mir-430-P9 Mml-Mir-430-P10 Mml-Mir-430-P12c Mml-Mir-430-P12d Mml-Mir-430-P12e Mml-Mir-430-P14a Mml-Mir-430-P14b Mml-Mir-430-P15 Mml-Mir-430-P16 Mml-Mir-430-P17 Mml-Mir-430-P18 Mml-Mir-430-P20 Mml-Mir-430-P21 Mml-Mir-430-P22 Mml-Mir-430-P24 Mml-Mir-430-P25 Mml-Mir-430-P27a Mml-Mir-430-P27b Mml-Mir-430-P28 Mml-Mir-430-P29a Mml-Mir-430-P29b-v1 Mml-Mir-430-P29c Mml-Mir-430-P30 Mml-Mir-430-P31 Mml-Mir-430-P32a1 Mml-Mir-430-P32a2 Mml-Mir-430-P32b Mml-Mir-430-P33 Mml-Mir-430-P34 Mml-Mir-430-P36a2 Mml-Mir-430-P36b Mml-Mir-430-P36c Mml-Mir-430-P38 Mml-Mir-430-P39 Mml-Mir-430-P42 Mml-Mir-430-P43 Mml-Mir-430-P44 Mml-Mir-430-P45a Mml-Mir-430-P45b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Cmi-Mir-430-o36 Hsa-Mir-430-P36 Pab-Mir-430-P36 Pbv-Mir-430-o36 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | M. mulatta | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_003339765.3_Mmul_10_traces) |
CM014354.1: 53487417-53487475 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-430-P36a1) |
Mir-430-P12c
CM014354.1: 53440288-53440350 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-430-P12d CM014354.1: 53441222-53441284 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P12e CM014354.1: 53442728-53442790 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P42 CM014354.1: 53444529-53444589 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P16 CM014354.1: 53447415-53447472 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P17 CM014354.1: 53449026-53449085 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P18 CM014354.1: 53453376-53453434 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P15 CM014354.1: 53454188-53454248 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P20 CM014354.1: 53456559-53456619 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P21 CM014354.1: 53457405-53457463 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P22 CM014354.1: 53459381-53459439 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P14a CM014354.1: 53460554-53460614 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P24 CM014354.1: 53462909-53462967 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P14b CM014354.1: 53467690-53467750 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P28 CM014354.1: 53472112-53472171 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P29a CM014354.1: 53474125-53474185 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P30 CM014354.1: 53475275-53475339 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P32a1 CM014354.1: 53480586-53480645 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P29b-v2 CM014354.1: 53481540-53481598 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P29b-v1 CM014354.1: 53481540-53481598 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P36a1 CM014354.1: 53487417-53487475 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P36b CM014354.1: 53490070-53490128 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P36a2 CM014354.1: 53491934-53491992 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P36c CM014354.1: 53494528-53494589 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P43 CM014354.1: 53495743-53495803 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P38 CM014354.1: 53501975-53502033 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P34 CM014354.1: 53504275-53504337 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P32a2 CM014354.1: 53507505-53507564 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P29c CM014354.1: 53509478-53509536 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P33 CM014354.1: 53510678-53510743 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P44 CM014354.1: 53516856-53516916 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P31 CM014354.1: 53518551-53518611 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P39 CM014354.1: 53520125-53520184 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P32b CM014354.1: 53522610-53522669 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P45a CM014354.1: 53524156-53524217 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P27b CM014354.1: 53525794-53525853 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P45b CM014354.1: 53528832-53528893 [+] UCSC Ensembl |
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| Seed | UCUAGAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UCUGGAGCAAGAAGAUCUCAUGAUGUGACUCUCUAGAGGAAAGCGCUUACUGUUGGCUAAAAAAAUAGGAAGCGCUUCUCUUUAGAGUGUUACGCUUUGAGAAAAGCAACGCGGAUCUUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UCUGGAGCAAGAAGAUC--| UGA U GA A UUGGCU UCA UGUGAC CUCUAGAG AAGCGCUU CUG \ AGU GCAUUG GAGAUUUC UUCGCGAA GAU A UUCUAGGCGCAACGAAAAG^ UUC U UC G AAAAAA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mml-Mir-430-P36a1_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0024355 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CUCUAGAGGAAAGCGCUUACUG -22
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-518d-5p |
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| Star sequence | Mml-Mir-430-P36a1_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0027121 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- GGAAGCGCUUCUCUUUAGAGUG -59
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-518d-3p |
