| MirGeneDB ID | Dno-Mir-430-P6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-430 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Nine-banded armadillo (Dasypus novemcinctus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dno-mir-372 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Dno-Mir-430-P1 Dno-Mir-430-P2 Dno-Mir-430-P3 Dno-Mir-430-P4 Dno-Mir-430-P5 Dno-Mir-430-P8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Cja-Mir-430-P6 Eca-Mir-430-P6 Hsa-Mir-430-P6 Mml-Mir-430-P6 Mmr-Mir-430-P6 Mmu-Mir-430-P6 Pab-Mir-430-P6 Rno-Mir-430-P6a Rno-Mir-430-P6b Xla-Mir-430-o6a Xla-Mir-430-o6b Xtr-Mir-430-o6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (dasNov3) |
JH570335: 104769-104828 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-430-P6) |
Mir-430-P8
JH570335: 73655-73715 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-430-P5 JH570335: 104581-104641 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P6 JH570335: 104769-104828 [+] UCSC Ensembl |
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| Seed | AAGUGCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UAACCUGGAACUAACUGCCCAGCCUGUGGUCCUCAAAUGUGGAGGCACUCUUCUGCUAUCUAAAUGGAAAGUGCUGCCAAAUUUGGGUGUCACCGGUGGACACUUUACAUCAAGCAACCAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UAACCUGGAACUAACUGC---| G U UC G A C GCUAU CCA CC GUGG CUCAAAU UGG GGCACU UUCU \ GGU GG CACU GGGUUUA ACC UCGUGA AAGG C ACCAACGAACUACAUUUCACA^ - C GU A G - UAAAU . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dno-Mir-430-P6_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | MIMAT0047844 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CCUCAAAUGUGGAGGCACUCUUCU -24
Get sequence
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| Mature sequence | Dno-Mir-430-P6_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0047845 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- AAAGUGCUGCCAAAUUUGGGUGU -60
Get sequence
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