MirGeneDB ID | Mml-Mir-199-P2-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-199 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | ACAGUAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Rhesus monkey (Macaca mulatta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | mml-mir-199a-2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Mml-Mir-199-P1-v1 Mml-Mir-199-P1-v2 Mml-Mir-199-P1-v3 Mml-Mir-199-P2-v1 Mml-Mir-199-P2-v3 Mml-Mir-199-P3-v1 Mml-Mir-199-P3-v2 Mml-Mir-199-P3-v3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aca-Mir-199-P2-v1 Aca-Mir-199-P2-v2 Aca-Mir-199-P2-v3 Ami-Mir-199-P2-v1 Ami-Mir-199-P2-v2 Ami-Mir-199-P2-v3 Bta-Mir-199-P2-v1 Bta-Mir-199-P2-v2 Bta-Mir-199-P2-v3 Cfa-Mir-199-P2-v1 Cfa-Mir-199-P2-v2 Cfa-Mir-199-P2-v3 Cpi-Mir-199-P2-v1 Cpi-Mir-199-P2-v2 Cpi-Mir-199-P2-v3 Cpo-Mir-199-P2-v1 Cpo-Mir-199-P2-v2 Cpo-Mir-199-P2-v3 Dre-Mir-199-P2-v1 Dre-Mir-199-P2-v2 Dre-Mir-199-P2-v3 Ete-Mir-199-P2-v1 Ete-Mir-199-P2-v2 Ete-Mir-199-P2-v3 Hsa-Mir-199-P2-v1 Hsa-Mir-199-P2-v2 Hsa-Mir-199-P2-v3 Mdo-Mir-199-P2-v1 Mdo-Mir-199-P2-v2 Mdo-Mir-199-P2-v3 Mmu-Mir-199-P2-v1 Mmu-Mir-199-P2-v2 Mmu-Mir-199-P2-v3 Ocu-Mir-199-P2-v1 Ocu-Mir-199-P2-v2 Ocu-Mir-199-P2-v3 Sha-Mir-199-P2-v1 Sha-Mir-199-P2-v2 Sha-Mir-199-P2-v3 Xtr-Mir-199-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (rheMac8) |
chr19: 10858567-10858629 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered MiRNAs (< 10kb from Mir-199-P2-v2) |
Mir-199-P2-v1
chr19: 10858567-10858629 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-199-P2-v2 chr19: 10858567-10858629 [-] UCSC Ensembl Mir-199-P2-v3 chr19: 10858567-10858629 [-] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UGCUGCGGGAUGGACAGCCGGCCUCGCCAACCCAGUGUUCAGACUACCUGUUCAGGAGGCUCUCAACGUGUACAGUAGUCUGCACAUUGGUUAGGCUGGGCUUGGGUGAGCGGCGCGUCGAGAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 UGCUGCGGGAUGGACAG- -| C AAC U C U GGAGGC CC GGCCU GCC CCAGUGU CAGACUAC UGU CA U GG UCGGG CGG GGUUACA GUCUGAUG ACA GU C AGAGCUGCGCGGCGAGUG U^ U AUU C - U GCAACU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Mml-Mir-199-P2-v2_5p* |
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MirBase accession | MIMAT0006231 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CCCAGUGUUCAGACUACCUGUUCA -24
Get sequence
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Validated targets |
TargetScanVert: mml-miR-199a-5p |
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Mature sequence | Mml-Mir-199-P2-v2_3p |
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MirBase accession | MIMAT0006232 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
40- UACAGUAGUCUGCACAUUGGUUA -63
Get sequence
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Validated targets |
TargetScanVert: mml-miR-199a-3p |