| MirGeneDB ID | Mal-Mir-137-P3b-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-137 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AUUGCUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Asian swamp eel (Monopterus albus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Mal-Mir-137-P1b-v1 Mal-Mir-137-P1b-v2 Mal-Mir-137-P3a-v1 Mal-Mir-137-P3a-v2 Mal-Mir-137-P3b-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aca-Mir-137-P3-v1 Aca-Mir-137-P3-v2 Ami-Mir-137-P3-v1 Ami-Mir-137-P3-v2 Asu-Mir-137 Bfl-Mir-137 Cbr-Mir-137 Cel-Mir-137 Cgi-Mir-137 Cli-Mir-137-P3 Cpi-Mir-137-P3-v1 Cpi-Mir-137-P3-v2 Cte-Mir-137 Dan-Mir-137 Dma-Mir-137 Dme-Mir-137 Dmo-Mir-137 Dpu-Mir-137 Dsi-Mir-137 Dya-Mir-137 Ebu-Mir-137 Esc-Mir-137 Gga-Mir-137-P3-v1 Gga-Mir-137-P3-v2 Gja-Mir-137-P3 Gmo-Mir-137-P3b-v1 Gmo-Mir-137-P3b-v2 Hme-Mir-137 Isc-Mir-137 Lan-Mir-137 Lch-Mir-137-P3 Lgi-Mir-137 Loc-Mir-137-P3-v1 Loc-Mir-137-P3-v2 Mdo-Mir-137-P3-v1 Mdo-Mir-137-P3-v2 Mun-Mir-137-P3 Oan-Mir-137-P3-v1 Oan-Mir-137-P3-v2 Obi-Mir-137 Pbv-Mir-137-P3-v1 Pbv-Mir-137-P3-v2 Pma-Mir-137-o3 Sha-Mir-137-P3 Sko-Mir-137 Spu-Mir-137 Tni-Mir-137-P3b Xbo-Mir-137 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Clupeocephala | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_001952655.1_M_albus_1.0_genomic) |
KV884720.1: 635728-635787 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GGAGGUGGGCCUCUUUGCUCCGGUCUCGACCACGGGUAUUCUUGGGUUGAUAAUACAGAUGUGGAUGUUAUUGCUUGAGAAUACGCGUAGUCGAGUGGAAGCUUUAUCAUCUACUGUGGAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 GGAGGUGGGCCUCUUUGC---| GU C G UG -- AUACAG UCCG CUCGAC ACG GUAUUCU GGU UGAUA \ AGGU GAGCUG UGC CAUAAGA UCG AUUGU A AGGUGUCAUCUACUAUUUCGA^ -- A G GU UU AGGUGU . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Mal-Mir-137-P3b-v2_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CACGGGUAUUCUUGGGUUGAUAA -23
Get sequence
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| Mature sequence | Mal-Mir-137-P3b-v2_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
38- UAUUGCUUGAGAAUACGCGUAG -60
Get sequence
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