MirGeneDB ID | Hme-Mir-210-P3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-210 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UUGUGCG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Longwing butterfly (Heliconius melpomene) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | hme-mir-210 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Hme-Mir-210-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aca-Mir-210 Ami-Mir-210 Bfl-Mir-210 Bla-Mir-210 Bta-Mir-210 Cfa-Mir-210 Cgi-Mir-210 Cli-Mir-210 Cmi-Mir-210 Cpi-Mir-210 Cpo-Mir-210 Dma-Mir-210 Dno-Mir-210 Dpu-Mir-210 Dre-Mir-210 Ebu-Mir-210 Efe-Mir-210 Ete-Mir-210 Gga-Mir-210 Gja-Mir-210 Gmo-Mir-210 Hsa-Mir-210 Isc-Mir-210 Lan-Mir-210 Lch-Mir-210 Lgi-Mir-210 Loc-Mir-210 Mal-Mir-210 Mdo-Mir-210 Mml-Mir-210 Mmu-Mir-210 Mun-Mir-210 Npo-Mir-210 Oan-Mir-210 Ocu-Mir-210 Pbv-Mir-210 Pma-Mir-210 Rno-Mir-210 Sha-Mir-210 Sko-Mir-210 Spt-Mir-210 Tgu-Mir-210 Tni-Mir-210 Xtr-Mir-210 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | H. melpomene | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Hmel_1) |
HE670563: 209742-209798 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-210-P3) |
Mir-210-P4
HE670563: 208640-208703 [-]
Ensembl
Mir-210-P3 HE670563: 209742-209798 [-] Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CCCUGGAAGAAGGCAAAUGAAGUCCAAAGCAGCUGCUGGCCACUGCACAAGAUUAGUAUAUACUCUUGUGCGUGUGACAGCGGCUAUUGCGGACCUUUCAUAAACAACGUGUCGAAGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 CCCUGGAAGAAGGCAAAU --| AA C GC - UUAGU GAA GUCC AG AGCUGCUG CAC UGCACAAGA \ CUU CAGG UU UCGGCGAC GUG GCGUGUUCU A GAAGCUGUGCAACAAAUA UC^ CG A A- U CAUAU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Hme-Mir-210-P3_5p* |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AGCUGCUGGCCACUGCACAAGA -22
Get sequence
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Mature sequence | Hme-Mir-210-P3_3p |
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mirBase accession | MIMAT0024947 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
34- CUUGUGCGUGUGACAGCGGCUAU -57
Get sequence
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