| MirGeneDB ID | Cpi-Mir-1677-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-1677 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Western painted turtle (Chrysemys picta bellii) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Cpi-Mir-1677-o6 Cpi-Mir-1677-o7 Cpi-Mir-1677-o8 Cpi-Mir-1677-P1a1 Cpi-Mir-1677-P1a2 Cpi-Mir-1677-P1b Cpi-Mir-1677-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Cli-Mir-1677-P2 Gga-Mir-1677-P2 Tgu-Mir-1677-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Archelosauria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Diapsida | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (chrPic1) |
JH584734: 2192414-2192475 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UUUGAAU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UACCAAUCUGGAGAAGAGCACCAUAGGCCUGAUCCAAAAGCUAUUAAAGUCAAUGGAAAGGGUCCCAUUGAUUUGAAUGGGCUUUGGAUCAGGCCCUAAUUGCACUGAUGUUCCUUUUACUAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 UACCAAUCUGGAGAAGA--| CCAUA AG A AUGGAAA GCA GGCCUGAUCCAAA CUAUU AAGUCA G CGU CCGGACUAGGUUU GGUAA UUUAGU G AUCAUUUUCCUUGUAGUCA^ UAAUC CG G UACCCUG 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Cpi-Mir-1677-P2_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GAUCCAAAAGCUAUUAAAGUCA -22
Get sequence
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| Mature sequence | Cpi-Mir-1677-P2_3p (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
40- AUUUGAAUGGGCUUUGGAUCAG -62
Get sequence
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