| MirGeneDB ID | Tgu-Mir-1677-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-1677 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Zebra finch (Taeniopygia guttata) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Tgu-Mir-1677-P1 Tgu-Mir-1677-P4 Tgu-Mir-1677-P5 Tgu-Mir-1677-P6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Cli-Mir-1677-P2 Cpi-Mir-1677-P2 Gga-Mir-1677-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Archelosauria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Diapsida | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (TaeGut1_add) |
8: 13816352-13816413 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CUUUAAU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GCACUGCCUUCUGAUCUGCAGUGUGGGCCUGAUCUAAAGCCUGUUUAAUUCAGUGGACUGAUUCCCAAUGACUUUAAUGGGCUUUGGAUUACACUCUAAUUGCACUGAUGUUCCUUUUAGUAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 GCACUGCCUUCUGAUCU--| GU CC U U GUGGACU GCAGU GGG UGAUCUAAAGCCUGUU AA UCA G CGUUA CUC AUUAGGUUUCGGGUAA UU AGU A AUGAUUUUCCUUGUAGUCA^ AU AC U C AACCCUU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14), UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Tgu-Mir-1677-P2_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GAUCUAAAGCCUGUUUAAUUCA -22
Get sequence
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| Mature sequence | Tgu-Mir-1677-P2_3p (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
40- ACUUUAAUGGGCUUUGGAUUAC -62
Get sequence
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