| MirGeneDB ID | Tni-Mir-725 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-725 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Pufferfish (Tetraodon nigroviridis) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Cmi-Mir-725 Cpi-Mir-725 Dre-Mir-725 Gmo-Mir-725 Lch-Mir-725 Loc-Mir-725 Mal-Mir-725 Sto-Mir-725 Xla-Mir-725-P1 Xla-Mir-725-P2 Xtr-Mir-725 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Tetraodon_nigroviridis.TETRAODON8.dna.toplevel) |
1: 16440623-16440684 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UCAGUCA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CAGUCCCACGCUCCUCUCAGUCCCACGCUCAGCUAGAAACUUUGCCUGGAAAUUUACUCGAUUGCAAAGUCUCAGUCAUUGUUUCUGGUCGUGCGUGUGACGCGCAUCCAAGGCCAGACGGCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CAGUCCCACGCUCCUCUCA-- C UCA UU C -| AAUUUACUC GUC CACGC GCUAGAAAC UG CUG GA \ CAG GUGCG UGGUCUUUG AC GAC CU G CGGCAGACCGGAACCUACGCG U UGC UU U U^ GAAACGUUA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Tni-Mir-725_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGCUAGAAACUUUGCCUGGAAA -22
Get sequence
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| Mature sequence | Tni-Mir-725_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
40- CUCAGUCAUUGUUUCUGGUCGU -62
Get sequence
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