| MirGeneDB ID | Cpi-Mir-725 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-725 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Western painted turtle (Chrysemys picta bellii) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Cmi-Mir-725 Dre-Mir-725 Gmo-Mir-725 Lch-Mir-725 Loc-Mir-725 Mal-Mir-725 Sto-Mir-725 Tni-Mir-725 Xla-Mir-725-P1 Xla-Mir-725-P2 Xtr-Mir-725 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (chrPic1) |
JH584849: 2587890-2587946 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UCAGUCA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UCUCUGGGAUCUGAGAUUGUGCAUCCACCUCACCUGAAACCGUGCCUGGAAUGACAUCAACCAAUUUCAGUCACUGUUUCUGGUGGAGUGGGUAGUCCACUGCGUCACCUACGACUUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UCUCUGGGAUCUGAGAU- UG -| CU U C C GACAU UG C AUCCAC CACC GAAAC GUG CUGGAAU \ AC G UGGGUG GUGG CUUUG CAC GACUUUA C UUCAGCAUCCACUGCGUC CU A^ AG U U U ACCAA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Cpi-Mir-725_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CACCUGAAACCGUGCCUGGAAU -22
Get sequence
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| Mature sequence | Cpi-Mir-725_3p (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
35- UUCAGUCACUGUUUCUGGUGGA -57
Get sequence
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