| MirGeneDB ID | Gmo-Mir-725 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-725 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Cod (Gadus morhua) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | gmo-mir-725 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Cmi-Mir-725 Cpi-Mir-725 Dre-Mir-725 Lch-Mir-725 Loc-Mir-725 Mal-Mir-725 Sto-Mir-725 Tni-Mir-725 Xla-Mir-725-P1 Xla-Mir-725-P2 Xtr-Mir-725 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Gadus_morhua.gadMor1.dna.toplevel) |
GeneScaffold_1908: 57443-57503 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UCAGUCA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CUUCCUUUCUGACUUUAUUGUUGCCCAUACAGCUGGAAACUUUGCCUGCAAAUUUAAGAGUUCAUGAAUUUCAGUCAUUGUUUCUGGUAGUGUGUGCAACAACUCAAGCUCCCAAAGAGUUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 CUUCCUUUCUGACUUUA--| C A UG UU C C UUAAGA UUGUUGC CAUAC GC GAAAC UG CUG AAAU G AACAACG GUGUG UG CUUUG AC GAC UUUA U UUGAGAAACCCUCGAACUC^ U A GU UU U - AGUACU . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Gmo-Mir-725_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0044159 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGCUGGAAACUUUGCCUGCAAAU -23
Get sequence
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| Mature sequence | Gmo-Mir-725_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0044160 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- UUCAGUCAUUGUUUCUGGUAGU -61
Get sequence
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