MirGeneDB ID | Tgu-Mir-32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-32 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Zebra finch (Taeniopygia guttata) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | tgu-mir-32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aca-Mir-32 Ami-Mir-32 Bta-Mir-32 Cfa-Mir-32 Cja-Mir-32 Cli-Mir-32 Cmi-Mir-32 Cpi-Mir-32 Cpo-Mir-32 Dno-Mir-32 Eca-Mir-32 Ete-Mir-32 Gga-Mir-32 Gja-Mir-32 Hsa-Mir-32 Laf-Mir-32 Lch-Mir-32 Mdo-Mir-32 Mml-Mir-32 Mmr-Mir-32 Mmu-Mir-32 Mun-Mir-32 Neu-Mir-32 Oan-Mir-32 Ocu-Mir-32 Pab-Mir-32 Pbv-Mir-32 Rno-Mir-32 Sha-Mir-32 Spt-Mir-32 Sto-Mir-32 Xla-Mir-32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (TaeGut1_add) |
2: 86006614-86006675 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AUUGCAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AAGCUCCCAUUCUGCUUGCUCUGGUGGAGAUAUUGCACAUUACUAAGUUGCACGUUCUCACGGCCUCAGUGCAAUUUAGUGUGUGCGAUACUUUCACAUGAGUGCAUGCACACGGGUAUGGCGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 60 AAGCUCCCAUUCUGCUU--| UG A U CGUUCUCA GCUC GUGGAG UAUUGCACAU ACUAAGUUGCA \ UGAG CACUUU AUAGCGUGUG UGAUUUAACGU C CGGUAUGGGCACACGUACG^ UA C - GACUCCGG 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UG at 5p(-14) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Tgu-Mir-32_5p |
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mirBase accession | MIMAT0014584 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UAUUGCACAUUACUAAGUUGCA -22
Get sequence
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Star sequence | Tgu-Mir-32_3p* |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
41- CAAUUUAGUGUGUGCGAUACU -62
Get sequence
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