MirGeneDB ID | Gga-Mir-32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-32 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AUUGCAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Chicken (Gallus gallus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | gga-mir-32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aca-Mir-32 Ami-Mir-32 Bta-Mir-32 Cfa-Mir-32 Cli-Mir-32 Cmi-Mir-32 Cpi-Mir-32 Cpo-Mir-32 Dno-Mir-32 Ete-Mir-32 Gja-Mir-32 Hsa-Mir-32 Lch-Mir-32 Mdo-Mir-32 Mml-Mir-32 Mmu-Mir-32 Mun-Mir-32 Oan-Mir-32 Ocu-Mir-32 Pbv-Mir-32 Rno-Mir-32 Sha-Mir-32 Spt-Mir-32 Sto-Mir-32 Tgu-Mir-32 Xla-Mir-32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Gallus_gallus.GRCg6a) |
2: 84220827-84220888 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | AAGCUCCCAUUCUGCUUGCUCUGGUGGAGAUAUUGCACAUUACUAAGUUGCAUGUUGUCACGGCCUCAGUGCAAUUUAGUGUGUGCGAUACUUUCACAUGAGUGCAUGCACACGGGUAUGGCGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 AAGCUCCCAUUCUGCUU--| UG A U UGUUGUCA GCUC GUGGAG UAUUGCACAU ACUAAGUUGCA \ UGAG CACUUU AUAGCGUGUG UGAUUUAACGU C CGGUAUGGGCACACGUACG^ UA C - GACUCCGG 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UG at 5p(-14), UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Gga-Mir-32_5p |
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mirBase accession | MIMAT0001125 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UAUUGCACAUUACUAAGUUGCA -22
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: gga-miR-32-5p miRDB: MIMAT0001125 |
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Star sequence | Gga-Mir-32_3p* |
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mirBase accession | MIMAT0026508 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
41- CAAUUUAGUGUGUGCGAUACU -62
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: gga-miR-32-3p miRDB: MIMAT0026508 |