MirGeneDB ID | Pbv-Mir-32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-32 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AUUGCAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Burmese python (Python bivittatus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | pbv-mir-32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aca-Mir-32 Ami-Mir-32 Bta-Mir-32 Cfa-Mir-32 Cli-Mir-32 Cmi-Mir-32 Cpi-Mir-32 Cpo-Mir-32 Dno-Mir-32 Ete-Mir-32 Gga-Mir-32 Gja-Mir-32 Hsa-Mir-32 Lch-Mir-32 Mdo-Mir-32 Mml-Mir-32 Mmu-Mir-32 Mun-Mir-32 Oan-Mir-32 Ocu-Mir-32 Rno-Mir-32 Sha-Mir-32 Spt-Mir-32 Sto-Mir-32 Tgu-Mir-32 Xla-Mir-32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_000186305.2_Python_molurus_bivittatus) |
KE958438.1: 46055-46116 [+] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | AAGUUCCCAUCCUGCUUGCUCUGGUGGUGAUAUUGCACAUUACUAAGUUGCAUGUUGUCACGGCCUCAGUGCAAUUUAGUGUGUGUGAUAUUUUCACAUGAGUGCAUGCACACAGGCUAUUUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 AAGUUCCCAUCCUGCUU--| UG U UG U UGUUGUCA GCUC GUGG GAUAU CACAU ACUAAGUUGCA \ UGAG CACU UUAUA GUGUG UGAUUUAACGU C UUUAUCGGACACACGUACG^ UA U GU - GACUCCGG 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UG at 5p(-14), UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Pbv-Mir-32_5p |
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mirBase accession | MIMAT0038881 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UAUUGCACAUUACUAAGUUGCA -22
Get sequence
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Star sequence | Pbv-Mir-32_3p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
41- CAAUUUAGUGUGUGUGAUAUU -62
Get sequence
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