| MirGeneDB ID | Cfa-Mir-32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-32 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AUUGCAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Dog (Canis familiaris) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | cfa-mir-32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aca-Mir-32 Ami-Mir-32 Bta-Mir-32 Cli-Mir-32 Cmi-Mir-32 Cpi-Mir-32 Cpo-Mir-32 Dno-Mir-32 Ete-Mir-32 Gga-Mir-32 Gja-Mir-32 Hsa-Mir-32 Lch-Mir-32 Mdo-Mir-32 Mml-Mir-32 Mmu-Mir-32 Mun-Mir-32 Oan-Mir-32 Ocu-Mir-32 Pbv-Mir-32 Rno-Mir-32 Sha-Mir-32 Spt-Mir-32 Sto-Mir-32 Tgu-Mir-32 Xla-Mir-32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (canFam3_add) |
chr11: 64197130-64197191 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | AUGCUCCCAUUCUGCUUGCUCUGGUGGAGAUAUUGCACAUUACUAAGUUGCAUGUUGUCACGGCCUCAAUGCAAUUUAGUGUGUGUGAUAUUUCCACAUGAGUGCAUGCACACGGGUAUGGCGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 AUGCUCCCAUUCUGCUU--| UG UG U UGUUGUCA GCUC GUGGAGAUAU CACAU ACUAAGUUGCA \ UGAG CACCUUUAUA GUGUG UGAUUUAACGU C CGGUAUGGGCACACGUACG^ UA GU - AACUCCGG 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14), UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Cfa-Mir-32_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0006597 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UAUUGCACAUUACUAAGUUGCA -22
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: cfa-miR-32 miRDB: MIMAT0006597 |
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| Star sequence | Cfa-Mir-32_3p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
41- CAAUUUAGUGUGUGUGAUAUU -62
Get sequence
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