| MirGeneDB ID | Mmr-Mir-450-P3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Family name | MIR-450 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Gray mouse lemur (Microcebus murinus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Mmr-Mir-450-P1 Mmr-Mir-450-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-450-P3 Cfa-Mir-450-P3 Cja-Mir-450-P3 Cpo-Mir-450-P3 Dno-Mir-450-P3 Eca-Mir-450-P3 Hsa-Mir-450-P3 Laf-Mir-450-P3 Mml-Mir-450-P3 Mmu-Mir-450-P3 Ocu-Mir-450-P3 Pab-Mir-450-P3 Rno-Mir-450-P3a Rno-Mir-450-P3b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_000165445.3_Mmur_3.0_genomic) |
CM007693.1: 64870489-64870546 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-450-P3) |
Mir-450-P3
CM007693.1: 64870489-64870546 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-450-P2 CM007693.1: 64870652-64870708 [-] UCSC Ensembl Mir-450-P1 CM007693.1: 64870824-64870880 [-] UCSC Ensembl Mir-542-v1 CM007693.1: 64871640-64871698 [-] UCSC Ensembl Mir-542-v2 CM007693.1: 64871641-64871697 [-] UCSC Ensembl Mir-15-P2c CM007693.1: 64876566-64876628 [-] UCSC Ensembl Mir-15-P1c CM007693.1: 64876908-64876966 [-] UCSC Ensembl |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UUUGCAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UUUUGUAAUAAAGGUAAAGUGCAGAAUUAUUUUUGCAAUGUUUUCCUGGAUAUGUAAUAUACAUGUAUUGGGAACAUUUUGCAUCCAUAGUUUUGUAUCAAUGUAUGGAGAAAAAGCUGet precursor sequence |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 UUUUGUAAUAAAGGUAAA--| UUU U U UG A GUAAU GUGCAGAAUUAU UGCAA GU UUCC G UAU \ UAUGUUUUGAUA ACGUU UA AAGG U AUG A UCGAAAAAGAGGUAUGUAAC^ CCU U C GU - UACAU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mature sequence | Mmr-Mir-450-P3_5p (predicted) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UUUUGCAAUGUUUUCCUGGAUAU -23
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Star sequence | Mmr-Mir-450-P3_3p* (predicted) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
36- AUUGGGAACAUUUUGCAUCCAU -58
Get sequence
|
