| MirGeneDB ID | Dsi-Mir-275 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-275 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Fruit fly (Drosophila simulans) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dsi-mir-275 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aae-Mir-275 Aga-Mir-275 Bge-Mir-275 Csc-Mir-275 Dan-Mir-275 Dlo-Mir-275 Dma-Mir-275 Dme-Mir-275 Dmo-Mir-275 Dpu-Mir-275 Dya-Mir-275 Gpa-Mir-275 Hme-Mir-275 Isc-Mir-275 Lpo-Mir-275-P3 Lpo-Mir-275-P4-v1 Lpo-Mir-275-P5 Lpo-Mir-275-P6 Lpo-Mir-275-P7 Tca-Mir-275 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Arthropoda | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Arthropoda | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Drosophila_simulans.ASM75419v3.dna.toplevel) |
2L: 7179688-7179749 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-275) |
Mir-275
2L: 7179688-7179749 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-305 2L: 7179853-7179913 [+] UCSC Ensembl |
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| Seed | CAGGUAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GUUCCCCCGGCUGAAAAGUCUCCUACCUUGCGCGCUAAUCAGUGACCGGGGCUGGUUUUUUAUAUACAGUCAGGUACCUGAAGUAGCGCGCGUGGUGGCAGACAUAUAUCUCCAUCUCCGCCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 GUUCCCCCGGCUGAAAA-- C U A-| UG GG GGUUUU GUCU CUACC UGCGCGCUA UCAG ACC GGCU U CAGA GGUGG GCGCGCGAU AGUC UGG CUGA U CCGCCUCUACCUCUAUAUA C U GA^ CA A- CAUAUA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dsi-Mir-275_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CGCGCUAAUCAGUGACCGGGGCU -23
Get sequence
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| Mature sequence | Dsi-Mir-275_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0008880 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- UCAGGUACCUGAAGUAGCGCGCG -62
Get sequence
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