| MirGeneDB ID | Dno-Mir-493 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-493 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Nine-banded armadillo (Dasypus novemcinctus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dno-mir-493 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-493 Cfa-Mir-493 Cja-Mir-493 Cpo-Mir-493 Eca-Mir-493 Ete-Mir-493 Hsa-Mir-493 Laf-Mir-493 Mml-Mir-493 Mmr-Mir-493 Mmu-Mir-493 Ocu-Mir-493 Pab-Mir-493 Rno-Mir-493 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (dasNov3) |
JH568228: 5543-5604 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-493) |
Mir-337-v1
JH568228: 2142-2201 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-337-v2 JH568228: 2142-2201 [-] UCSC Ensembl Mir-493 JH568228: 5543-5604 [-] UCSC Ensembl |
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| Seed | UGUACAU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CUCGCCGCGUGCUCUCUGGCCUCCAGGGCCUUGUACAUGGUAGGCUUUCACCCCUCGGUUGCUUAGCCGGUGAAGGCCUACUGUGUACCAGGCCCUGUGCCAGACUUCAAGUGGACGGACGCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 CUCGCCGCGUGCUCUCU----| CUC U CCUCGGU GGC CAGGGCCU GUACAUGGUAGGCUUUCACC U CCG GUCCCGGA CAUGUGUCAUCCGGAAGUGG G CGCAGGCAGGUGAACUUCAGA^ U-- C CCGAUUC 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Dno-Mir-493_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0047926 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UUGUACAUGGUAGGCUUUCACC -22
Get sequence
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| Star sequence | Dno-Mir-493_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0047927 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
40- UGAAGGCCUACUGUGUACCAGG -62
Get sequence
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