MirGeneDB 3.0

74 microRNA genes with node of origin D. rerio

						Sort by genome coordinates								Motifs
MirGeneDB ID ▲	MiRBase ID	Family	Seed	5p accession	3p accession	Chromosome	Start	End	Strand	Node of origin (locus)	Node of origin (family)	Iso­miR	3' NTU	UG	UGUG	CNNC
Dre-Mir-30-P1o1	dre-mir-30a	MIR-30	GUAAACA	MIMAT0001803	MIMAT0031951	chr19	4737589	4737653	+	D. rerio	Vertebrata		No	1		1
Dre-Mir-430-o1a	dre-mir-430a-1	MIR-430	AAGUGCU	None	MIMAT0001423	chr10	4493289	4493347	+	D. rerio	Vertebrata		No			1
Dre-Mir-430-o1b1	dre-mir-430a-2	MIR-430	AAGUGCU	MIMAT0031994	MIMAT0001423	chr4	28694962	28695020	+	D. rerio	Vertebrata		No			1
Dre-Mir-430-o1b2	dre-mir-430a-3	MIR-430	AAGUGCU	MIMAT0031994	MIMAT0001423	chr4	28696703	28696761	+	D. rerio	Vertebrata		No			1
Dre-Mir-430-o1b3	dre-mir-430a-5	MIR-430	AAGUGCU	MIMAT0031994	MIMAT0001423	chr4	28699047	28699105	+	D. rerio	Vertebrata		No			1
Dre-Mir-430-o1b4	dre-mir-430a-6	MIR-430	AAGUGCU	MIMAT0031994	MIMAT0001423	chr4	28700810	28700868	+	D. rerio	Vertebrata		No			1
Dre-Mir-430-o1b5	dre-mir-430a-7	MIR-430	AAGUGCU	MIMAT0031994	MIMAT0001423	chr4	28708442	28708500	+	D. rerio	Vertebrata		No			1
Dre-Mir-430-o1b6	dre-mir-430a-8	MIR-430	AAGUGCU	MIMAT0031994	MIMAT0001423	chr4	28706702	28706760	+	D. rerio	Vertebrata		No			1
Dre-Mir-430-o1b7	dre-mir-430a-9	MIR-430	AAGUGCU	MIMAT0031994	MIMAT0001423	chr4	28704939	28704997	+	D. rerio	Vertebrata		No			1
Dre-Mir-430-o1b8	dre-mir-430a-10	MIR-430	AAGUGCU	MIMAT0031994	MIMAT0001423	chr4	28703199	28703257	+	D. rerio	Vertebrata		No			1
Dre-Mir-430-o1c	dre-mir-430a-11	MIR-430	AAGUGCU	MIMAT0031996	MIMAT0001423	chr4	28701436	28701494	+	D. rerio	Vertebrata		No			1
Dre-Mir-430-o1d1	dre-mir-430a-4	MIR-430	AAGUGCU	MIMAT0031995	MIMAT0001423	chr4	28693846	28693904	+	D. rerio	Vertebrata		No			1
Dre-Mir-430-o1d2	dre-mir-430a-12	MIR-430	AAGUGCU	MIMAT0031997	MIMAT0001423	chr4	28695588	28695646	+	D. rerio	Vertebrata		No			1
Dre-Mir-430-o1d3	dre-mir-430a-13	MIR-430	AAGUGCU	MIMAT0031998	MIMAT0001423	chr4	28697329	28697387	+	D. rerio	Vertebrata		No			1
Dre-Mir-430-o1d4	dre-mir-430a-14	MIR-430	AAGUGCU	MIMAT0031999	MIMAT0001423	chr4	28697933	28697991	+	D. rerio	Vertebrata		No			1
Dre-Mir-430-o1d5	dre-mir-430a-15	MIR-430	AAGUGCU	MIMAT0032000	MIMAT0001423	chr4	28703825	28703883	+	D. rerio	Vertebrata		No			1
Dre-Mir-430-o1d6	dre-mir-430a-16	MIR-430	AAGUGCU	MIMAT0032001	MIMAT0001423	chr4	28709068	28709126	+	D. rerio	Vertebrata		No			1
Dre-Mir-430-o1d7	dre-mir-430a-17	MIR-430	AAGUGCU	MIMAT0032002	MIMAT0001423	chr4	28707328	28707386	+	D. rerio	Vertebrata		No			1
Dre-Mir-430-o1e1	dre-mir-430i-1	MIR-430	CCCUCAC	MIMAT0032003	MIMAT0001880	chr4	28699673	28699731	+	D. rerio	Vertebrata		No			1
Dre-Mir-430-o1e2	dre-mir-430i-2	MIR-430	CCCUCAC	MIMAT0032003	MIMAT0001880	chr4	28702062	28702120	+	D. rerio	Vertebrata		No			1
Dre-Mir-430-o1e3	dre-mir-430i-3	MIR-430	CCCUCAC	MIMAT0032003	MIMAT0001880	chr4	28705565	28705623	+	D. rerio	Vertebrata		No			1
Dre-Mir-430-o2a1	dre-mir-430b-1	MIR-430	AAGUGCU	MIMAT0031928	MIMAT0001424	chr4	28694231	28694289	+	D. rerio	Vertebrata		No			1
Dre-Mir-430-o2a2	dre-mir-430b-2	MIR-430	AAGUGCU	MIMAT0031928	MIMAT0001424	chr4	28695382	28695440	+	D. rerio	Vertebrata		No			1
Dre-Mir-430-o2a3	dre-mir-430b-3	MIR-430	AAGUGCU	MIMAT0031928	MIMAT0001424	chr4	28695972	28696030	+	D. rerio	Vertebrata		No			1
Dre-Mir-430-o2a4	dre-mir-430b-5	MIR-430	AAGUGCU	MIMAT0031928	MIMAT0001424	chr4	28697727	28697785	+	D. rerio	Vertebrata		No			1
Dre-Mir-430-o2a5	dre-mir-430b-10	MIR-430	AAGUGCU	MIMAT0031928	MIMAT0001424	chr4	28699467	28699525	+	D. rerio	Vertebrata		No			1
Dre-Mir-430-o2a6	dre-mir-430b-11	MIR-430	AAGUGCU	MIMAT0031928	MIMAT0001424	chr4	28700079	28700137	+	D. rerio	Vertebrata		No			1
Dre-Mir-430-o2a7	dre-mir-430b-12	MIR-430	AAGUGCU	MIMAT0031928	MIMAT0001424	chr4	28701856	28701914	+	D. rerio	Vertebrata		No			1
Dre-Mir-430-o2a8	dre-mir-430b-13	MIR-430	AAGUGCU	MIMAT0031928	MIMAT0001424	chr4	28709466	28709524	+	D. rerio	Vertebrata		No			1
Dre-Mir-430-o2a9	dre-mir-430b-14	MIR-430	AAGUGCU	MIMAT0031928	MIMAT0001424	chr4	28707712	28707770	+	D. rerio	Vertebrata		No			1
Dre-Mir-430-o2a10	dre-mir-430b-15	MIR-430	AAGUGCU	MIMAT0031928	MIMAT0001424	chr4	28707122	28707180	+	D. rerio	Vertebrata		No			1
Dre-Mir-430-o2a11	dre-mir-430b-16	MIR-430	AAGUGCU	MIMAT0031928	MIMAT0001424	chr4	28705971	28706029	+	D. rerio	Vertebrata		No			1
Dre-Mir-430-o2a12	dre-mir-430b-17	MIR-430	AAGUGCU	MIMAT0031928	MIMAT0001424	chr4	28705359	28705417	+	D. rerio	Vertebrata		No			1
Dre-Mir-430-o2a13	dre-mir-430b-18	MIR-430	AAGUGCU	MIMAT0031928	MIMAT0001424	chr4	28703619	28703677	+	D. rerio	Vertebrata		No			1
Dre-Mir-430-o2a14	dre-mir-430b-19	MIR-430	AAGUGCU	MIMAT0031928	MIMAT0001424	chr4	28702468	28702526	+	D. rerio	Vertebrata		No			1
Dre-Mir-430-o2b	dre-mir-430b-4	MIR-430	AAGUGCU	MIMAT0031928	MIMAT0001424	chr4	28693640	28693698	+	D. rerio	Vertebrata		No			1
Dre-Mir-430-o2c1	dre-mir-430b-6	MIR-430	AAGUGCU	MIMAT0031928	MIMAT0001424	chr4	28697123	28697181	+	D. rerio	Vertebrata		No			1
Dre-Mir-430-o2c2	dre-mir-430b-7	MIR-430	AAGUGCU	MIMAT0031928	MIMAT0001424	chr4	28701230	28701288	+	D. rerio	Vertebrata		No			1
Dre-Mir-430-o2c3	dre-mir-430b-8	MIR-430	AAGUGCU	MIMAT0031928	MIMAT0001424	chr4	28708862	28708920	+	D. rerio	Vertebrata		No			1
Dre-Mir-430-o2d1	dre-mir-430b-9	MIR-430	AAGUGCU	MIMAT0031928	MIMAT0001424	chr4	28698317	28698375	+	D. rerio	Vertebrata		No			1
Dre-Mir-430-o2d2	dre-mir-430b-20	MIR-430	AAGUGCU	MIMAT0031928	MIMAT0001424	chr4	28704209	28704267	+	D. rerio	Vertebrata		No			1
Dre-Mir-430-o3a1	dre-mir-430c-1	MIR-430	AAGUGCU	MIMAT0031929	MIMAT0001425	chr4	28693379	28693437	+	D. rerio	Vertebrata		No		1	1
Dre-Mir-430-o3a2	dre-mir-430c-2	MIR-430	AAGUGCU	MIMAT0031929	MIMAT0001425	chr4	28693983	28694041	+	D. rerio	Vertebrata		No		1	1
Dre-Mir-430-o3a3	dre-mir-430c-3	MIR-430	AAGUGCU	MIMAT0031929	MIMAT0001425	chr4	28695121	28695179	+	D. rerio	Vertebrata		No		1	1
Dre-Mir-430-o3a4	dre-mir-430c-4	MIR-430	AAGUGCU	MIMAT0031929	MIMAT0001425	chr4	28695725	28695783	+	D. rerio	Vertebrata		No		1	1
Dre-Mir-430-o3a5	dre-mir-430c-5	MIR-430	AAGUGCU	MIMAT0031929	MIMAT0001425	chr4	28696862	28696920	+	D. rerio	Vertebrata		No		1	1
Dre-Mir-430-o3a6	dre-mir-430c-6	MIR-430	AAGUGCU	MIMAT0031929	MIMAT0001425	chr4	28697466	28697524	+	D. rerio	Vertebrata		No		1	1
Dre-Mir-430-o3a7	dre-mir-430c-7	MIR-430	AAGUGCU	MIMAT0031929	MIMAT0001425	chr4	28699206	28699264	+	D. rerio	Vertebrata		No		1	1
Dre-Mir-430-o3a8	dre-mir-430c-8	MIR-430	AAGUGCU	MIMAT0031929	MIMAT0001425	chr4	28709205	28709263	+	D. rerio	Vertebrata		No		1	1
Dre-Mir-430-o3a9	dre-mir-430c-9	MIR-430	AAGUGCU	MIMAT0031929	MIMAT0001425	chr4	28708601	28708659	+	D. rerio	Vertebrata		No		1	1
Dre-Mir-430-o3a10	dre-mir-430c-10	MIR-430	AAGUGCU	MIMAT0031929	MIMAT0001425	chr4	28707465	28707523	+	D. rerio	Vertebrata		No		1	1
Dre-Mir-430-o3a11	dre-mir-430c-11	MIR-430	AAGUGCU	MIMAT0031929	MIMAT0001425	chr4	28706861	28706919	+	D. rerio	Vertebrata		No		1	1
Dre-Mir-430-o3a12	dre-mir-430c-12	MIR-430	AAGUGCU	MIMAT0031929	MIMAT0001425	chr4	28705724	28705782	+	D. rerio	Vertebrata		No		1	1
Dre-Mir-430-o3a13	dre-mir-430c-13	MIR-430	AAGUGCU	MIMAT0031929	MIMAT0001425	chr4	28702221	28702279	+	D. rerio	Vertebrata		No		1	1
Dre-Mir-430-o3a14	dre-mir-430c-14	MIR-430	AAGUGCU	MIMAT0031929	MIMAT0001425	chr4	28701595	28701653	+	D. rerio	Vertebrata		No		1	1
Dre-Mir-430-o3a15	dre-mir-430c-15	MIR-430	AAGUGCU	MIMAT0031929	MIMAT0001425	chr4	28700969	28701027	+	D. rerio	Vertebrata		No		1	1
Dre-Mir-430-o3a16	dre-mir-430c-16	MIR-430	AAGUGCU	MIMAT0031929	MIMAT0001425	chr4	28699832	28699890	+	D. rerio	Vertebrata		No		1	1
Dre-Mir-430-o3b1	None	MIR-430	AAGUGCU	None	None	chr4	28698070	28698128	+	D. rerio	Vertebrata		No		1	1
Dre-Mir-430-o3b2	None	MIR-430	AAGUGCU	None	None	chr4	28703962	28704020	+	D. rerio	Vertebrata		No		1	1
Dre-Mir-732	dre-mir-732	MIR-732	UCAAAGC	None	MIMAT0003762	chr9	41682940	41682998	+	D. rerio	D. rerio		No
Dre-Mir-2184-P1a	dre-mir-2184	MIR-2184	ACAGUAA	MIMAT0011288	None	chr10	35654276	35654332	-	D. rerio	Gnathostomata		No	1		1
Dre-Mir-2184-P1b	None	MIR-2184	ACAGUAA	None	None	LKPD01047922.1	7188	7244	+	D. rerio	Gnathostomata		No	1		1
Dre-Mir-2189	dre-mir-2189	MIR-2189	GAUUGUU	None	MIMAT0011311	chrUn_KN150127v1	17180	17237	+	D. rerio	D. rerio		No			1
Dre-Mir-2191	dre-mir-2191	MIR-2191	CACACCU	None	MIMAT0011300	chr23	36790250	36790310	+	D. rerio	D. rerio		No			1
Dre-Mir-7148	dre-mir-7148	MIR-7148	AUGGAAA	MIMAT0028206	MIMAT0028207	chr2	57103411	57103473	-	D. rerio	D. rerio		No
Dre-Mir-7149	dre-mir-7149	MIR-7149	UCCAAGU	MIMAT0028208	MIMAT0028209	chr23	24074089	24074151	+	D. rerio	D. rerio		No
Dre-Novel-1	None	DRE-NOVEL-1	AUUUUCU	None	None	chr18	15584378	15584438	-	D. rerio	D. rerio		No
Dre-Novel-2	None	DRE-NOVEL-2	UAUGUGU	None	None	chr19	6275796	6275851	-	D. rerio	D. rerio		No	1
Dre-Novel-3	None	DRE-NOVEL-3	CUGAUCA	None	None	chr17	52860985	52861045	+	D. rerio	D. rerio		No			1
Dre-Novel-4	None	DRE-NOVEL-4	CAGGAAU	None	None	chr15	37725346	37725406	-	D. rerio	D. rerio		No
Dre-Novel-5	None	DRE-NOVEL-5	CAUGUCA	None	None	chr9	56359312	56359379	-	D. rerio	D. rerio		No		1	1
Dre-Novel-6	None	DRE-NOVEL-6	ACAAGGG	None	None	chr3	26193747	26193808	+	D. rerio	D. rerio		No			1
Dre-Novel-7	None	DRE-NOVEL-7	GGGCGAU	None	None	chr22	364003	364066	-	D. rerio	D. rerio		No	1	1
Dre-Novel-8	None	DRE-NOVEL-8	AAAUAAU	None	None	chr4	6920268	6920338	+	D. rerio	D. rerio		No	1		1

(red - mature/co-mature, blue - star)

Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all