| MirGeneDB ID | Tur-Mir-76 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-76 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Two-spotted spider mite (Tetranychus urticae) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aae-Mir-76 Aga-Mir-76 Agr-Mir-76 Asu-Mir-76 Ava-Mir-76-P11 Ava-Mir-76-P12 Bge-Mir-76 Bko-Mir-76 Bpl-Mir-76 Cbr-Mir-76 Cel-Mir-76 Csc-Mir-76-P10a Csc-Mir-76-P10b Cte-Mir-76 Dan-Mir-76 Dgr-Mir-76 Dlo-Mir-76 Dma-Mir-76 Dme-Mir-76 Dmo-Mir-76 Dpu-Mir-76 Dsi-Mir-76 Dya-Mir-76 Eba-Mir-76 Efe-Mir-76 Esc-Mir-76 Gpa-Mir-76 Gsa-Mir-76 Hme-Mir-76 Hru-Mir-76 Isc-Mir-76 Lan-Mir-76-P1 Lan-Mir-76-P2 Lgi-Mir-76 Llo-Mir-76 Lpo-Mir-76-P3 Lpo-Mir-76-P4 Lpo-Mir-76-P5 Lpo-Mir-76-P6 Lpo-Mir-76-P7 Lpo-Mir-76-P8 Mgi-Mir-76 Mom-Mir-76 Npo-Mir-76 Obi-Mir-76 Ofu-Mir-76 Ovu-Mir-76 Pau-Mir-76 Pcr-Mir-76 Pdu-Mir-76 Pmi-Mir-76 Pve-Mir-76 Rph-Mir-76 Sma-Mir-76 Sme-Mir-76-P9a Sme-Mir-76-P9b Snu-Mir-76 Spu-Mir-76 Tca-Mir-76 War-Mir-76 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Nephrozoa | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Nephrozoa | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_000239435.1_ASM23943v1_genomic_TUR_traces) |
gb|CM077717.1|:17556145-17556464: 80-232 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UCGUUGU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AAUAAUCUGGAAAUGUUAAUGGAUAAGGUUCGGGUUUGGGCGAUCGGCGAACAUUGGCUGUUGAUCAAUCUCCACUUAUCAAGGUUAAUCAGUGAAUUAAUAAGGUUAAUCAUGACAUCUUGGUAAACGGAUUUUGGUUCAACGUCUUUUAAAUCAAUCUGUUCGUUGUCGUCAAAACCUGAAUUGAGAUCCAUAAAUCAACGGGCAAAAAAAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 AAUAAUCUGGAAAUGUUA- AA-| G U UUGGCUGUUGAUCAAUCUCCACUUAUCAAGGUUAAUCAGUGAAUUAAUAAGG AUGGAU GGUUCGGGUUU GGCGA CGGCGAACA U UACCUA UUAAGUCCAAA CUGCU GUUGCUUGU U AAAAAAACGGGCAACUAAA GAG^ A - CUAACUAAAUUUUCUGCAACUUGGUUUUAGGCAAAUGGUUCUACAGUACUAA 210 200 190 180 170 160 150 140 130 120 110 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Tur-Mir-76_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CGGGUUUGGGCGAUCGGCGAACA -23
Get sequence
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| Mature sequence | Tur-Mir-76_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
131- UUCGUUGUCGUCAAAACCUGAA -153
Get sequence
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