MirGeneDB ID | Esc-Mir-76 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-76 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Hawaiian bobtail squid (Euprymna scolopes) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aae-Mir-76 Aga-Mir-76 Agr-Mir-76 Asu-Mir-76 Ava-Mir-76-P11 Ava-Mir-76-P12 Bge-Mir-76 Bko-Mir-76 Bpl-Mir-76 Cbr-Mir-76 Cel-Mir-76 Csc-Mir-76-P10a Csc-Mir-76-P10b Cte-Mir-76 Dan-Mir-76 Dgr-Mir-76 Dlo-Mir-76 Dma-Mir-76 Dme-Mir-76 Dmo-Mir-76 Dpu-Mir-76 Dsi-Mir-76 Dya-Mir-76 Eba-Mir-76 Efe-Mir-76 Gpa-Mir-76 Gsa-Mir-76 Hme-Mir-76 Hru-Mir-76 Isc-Mir-76 Lan-Mir-76-P1 Lan-Mir-76-P2 Lgi-Mir-76 Llo-Mir-76 Lpo-Mir-76-P3 Lpo-Mir-76-P4 Lpo-Mir-76-P5 Lpo-Mir-76-P6 Lpo-Mir-76-P7 Lpo-Mir-76-P8 Mgi-Mir-76 Mom-Mir-76 Npo-Mir-76 Obi-Mir-76 Ofu-Mir-76 Ovu-Mir-76 Pau-Mir-76 Pcr-Mir-76 Pdu-Mir-76 Pmi-Mir-76 Pve-Mir-76 Rph-Mir-76 Sma-Mir-76 Sme-Mir-76-P9a Sme-Mir-76-P9b Snu-Mir-76 Spu-Mir-76 Tca-Mir-76 Tur-Mir-76 War-Mir-76 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Nephrozoa | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Nephrozoa | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (esc-GCA_024364805.1_ASM2436480v1) |
CM044501.1: 38963160-38963220 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UCGUUGU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GCUUGUCCCUAACGACGGUAAGCUAUUUUGACGGGUUUCGUGACAGGCGAGCAUAAAAUCCAUAAUUGUUCGUUGUCGACGAAACCUGCCUGAAAUAGCCAACCAGAGCACAUUUGCGGACGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 GCUUGUCCCUAACGACG- AA A- -| G UAAAAU GU GCUAUUUUG CGGGUUUCGU GACAG CGAGCA \ CA CGAUAAAGU GUCCAAAGCA CUGUU GCUUGU C CAGGCGUUUACACGAGAC AC CC G^ - UAAUAC . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Esc-Mir-76_5p* |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- ACGGGUUUCGUGACAGGCGAGCA -23
Get sequence
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Mature sequence | Esc-Mir-76_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
38- UUCGUUGUCGACGAAACCUGCCU -61
Get sequence
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