| MirGeneDB ID | Neu-Mir-7371-o31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-7371 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Tammar Wallaby (Notamacropus eugenii) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Neu-Mir-7371-o29 Neu-Mir-7371-o30 Neu-Mir-7371-o31-v1 Neu-Mir-7371-o32-v1 Neu-Mir-7371-o33 Neu-Mir-7371-P11 Neu-Mir-7371-P12a Neu-Mir-7371-P12b Neu-Mir-7371-P15 Neu-Mir-7371-P17 Neu-Mir-7371-P18 Neu-Mir-7371-P19-v1 Neu-Mir-7371-P20 Neu-Mir-7371-P24 Neu-Mir-7371-P25 Neu-Mir-7371-P28a Neu-Mir-7371-P28b Neu-Mir-7371-P29 Neu-Mir-7371-P39 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Mdo-Mir-7371-P31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | N. eugenii | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Marsupialia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_028372415.1_mMacEug1.pri) |
CM051820.1: 69292320-69292382 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-7371-o31-v2) |
Mir-7371-o29
CM051820.1: 69242583-69242643 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-7371-o33 CM051820.1: 69271675-69271736 [-] UCSC Ensembl Mir-7371-o32-v2 CM051820.1: 69280802-69280864 [-] UCSC Ensembl Mir-7371-o32-v1 CM051820.1: 69280803-69280863 [-] UCSC Ensembl Mir-7371-o31-v2 CM051820.1: 69292320-69292382 [-] UCSC Ensembl Mir-7371-o31-v1 CM051820.1: 69292321-69292381 [-] UCSC Ensembl Mir-7371-o30 CM051820.1: 69294479-69294539 [-] UCSC Ensembl |
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| Variant | Neu-Mir-7371-o31-v2 |
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| Seed | CCUUUGU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GCUGGUCUCAGUCUCUUUCCUCCACUUACCCCCUUUGUAUCAGAGACUGUCUUGUAUAGAAGUCAUCAAAGACACUGUCUGGUACAAAGCAGGUGCUUGGGGUACCACAUUCACUUUUUGAAGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 GCUGGUCUCAGUCUCUUUC--| CU CC GAC GUAUAGA CUCCA UACC CUUUGUAUCAGA UGUCUU \ GGGGU GUGG GAAACAUGGUCU ACAGAA A GAAGUUUUUCACUUACACCAU^ UC AC GUC ACUACUG 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Neu-Mir-7371-o31-v2_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CCCUUUGUAUCAGAGACUGUCUU -23
Get sequence
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| Star sequence | Neu-Mir-7371-o31-v2_3p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
40- GACACUGUCUGGUACAAAGCAGG -63
Get sequence
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| Variant | Neu-Mir-7371-o31-v1 |
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| Seed | CUUUGUA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CUGGUCUCAGUCUCUUUCCUCCACUUACCCCCUUUGUAUCAGAGACUGUCUUGUAUAGAAGUCAUCAAAGACACUGUCUGGUACAAAGCAGGUGCUUGGGGUACCACAUUCACUUUUUGAAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CUGGUCUCAGUCUCUUUC--| CU CC GAC GUAUAGA CUCCA UACC CUUUGUAUCAGA UGUCUU \ GGGGU GUGG GAAACAUGGUCU ACAGAA A AAGUUUUUCACUUACACCAU^ UC AC GUC ACUACUG . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Neu-Mir-7371-o31-v1_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CCUUUGUAUCAGAGACUGUCUU -22
Get sequence
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| Star sequence | Neu-Mir-7371-o31-v1_3p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- GACACUGUCUGGUACAAAGCAG -61
Get sequence
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