| MirGeneDB ID | Mun-Mir-223 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-223 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Microcaecilia (Microcaecilia unicolor) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aca-Mir-223 Ami-Mir-223 Bta-Mir-223 Cfa-Mir-223 Cja-Mir-223 Cli-Mir-223 Cmi-Mir-223 Cpi-Mir-223 Cpo-Mir-223 Dno-Mir-223 Dre-Mir-223 Ebu-Mir-223 Eca-Mir-223 Ete-Mir-223 Gga-Mir-223 Gja-Mir-223 Gmo-Mir-223 Hsa-Mir-223-v1 Laf-Mir-223 Lch-Mir-223 Loc-Mir-223 Mal-Mir-223 Mdo-Mir-223 Mml-Mir-223 Mmr-Mir-223 Mmu-Mir-223 Neu-Mir-223 Oan-Mir-223 Ocu-Mir-223 Pab-Mir-223 Pbv-Mir-223 Pma-Mir-223 Rno-Mir-223 Sha-Mir-223 Spt-Mir-223 Sto-Mir-223 Tgu-Mir-223 Tni-Mir-223 Xla-Mir-223 Xtr-Mir-223 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_901765095.2_aMicUni1.2) |
LR594638.1: 10404951-10405016 [-] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GUCAGUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
ACGUGGACAUCUGGGCACGGCGUUGCGCUCCGUAUAUUUGAUAAGCUGAAUUUGACACUCAUUUGUGGUAGAGUGUCAGUUUAUCAAAUAUUCUAAGCGAGGCGUCUGAUCAGCAGCCACACUACCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 ACGUGGACAUCUGGGCAC-- UG CCGU -| GACACUCA GGCGU CGCU AUAUUUGAUAAGCUGA AUUU \ CUGCG GCGA UAUAAACUAUUUGACU UGAG U CCAUCACACCGACGACUAGU GA AUCU G^ AUGGUGUU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Mun-Mir-223_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CGUAUAUUUGAUAAGCUGAAUUU -23
Get sequence
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| Mature sequence | Mun-Mir-223_3p (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
43- UGUCAGUUUAUCAAAUAUUCUAA -66
Get sequence
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