| MirGeneDB ID | Mmr-Mir-582 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-582 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Gray mouse lemur (Microcebus murinus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-582-v1 Cfa-Mir-582-v1 Cja-Mir-582 Cpo-Mir-582-v1 Dno-Mir-582-v1 Eca-Mir-582 Hsa-Mir-582-v1 Laf-Mir-582-v1 Mml-Mir-582-v1 Mmu-Mir-582-v1 Ocu-Mir-582 Pab-Mir-582-v1 Rno-Mir-582-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_000165445.3_Mmur_3.0_genomic) |
CM007672.1: 53473665-53473724 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-582-v1) |
Mir-582-v1
CM007672.1: 53473665-53473724 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-582-v2 CM007672.1: 53473666-53473723 [-] UCSC Ensembl |
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| Variant | Mmr-Mir-582-v1 |
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| Seed | UACAGUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GACUUCAACAAGUCAAUCUGUACUCUUUGGUUACAGUUGUUCAACCAGUUACUAAUCUAACAAAUUGUAACCGGUUGAACAACUGAACCCAAAGGGUGCAAAGUAGAAACAUUUCAUUGAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 GACUUCAACAAGUCAAUC--| UUA A UAAUCU UGUACUCUUUGG CAGUUGUUCAACC GUUAC A ACGUGGGAAACC GUCAACAAGUUGG CAAUG A AGUUACUUUACAAAGAUGAA^ CAA C UUAAAC . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mmr-Mir-582-v1_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UUACAGUUGUUCAACCAGUUACU -23
Get sequence
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| Co-mature sequence | Mmr-Mir-582-v1_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- UAACCGGUUGAACAACUGAACCC -60
Get sequence
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| Variant | Mmr-Mir-582-v2 |
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| Seed | ACAGUUG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
ACUUCAACAAGUCAAUCUGUACUCUUUGGUUACAGUUGUUCAACCAGUUACUAAUCUAACAAAUUGUAACCGGUUGAACAACUGAACCCAAAGGGUGCAAAGUAGAAACAUUUCAUUGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 ACUUCAACAAGUCAAUC--| UUA A UAAUCU UGUACUCUUUGG CAGUUGUUCAACC GUUAC A ACGUGGGAAACC GUCAACAAGUUGG CAAUG A GUUACUUUACAAAGAUGAA^ CAA C UUAAAC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mmr-Mir-582-v2_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UACAGUUGUUCAACCAGUUACU -22
Get sequence
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| Co-mature sequence | Mmr-Mir-582-v2_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
36- UAACCGGUUGAACAACUGAACC -58
Get sequence
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