| MirGeneDB ID | Dno-Mir-582 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-582 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Nine-banded armadillo (Dasypus novemcinctus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dno-mir-582 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-582-v1 Cfa-Mir-582-v1 Cja-Mir-582 Cpo-Mir-582-v1 Eca-Mir-582 Hsa-Mir-582-v1 Laf-Mir-582-v1 Mml-Mir-582-v1 Mmr-Mir-582-v1 Mmu-Mir-582-v1 Ocu-Mir-582 Pab-Mir-582-v1 Rno-Mir-582-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (dasNov3) |
JH568145: 3349266-3349325 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-582-v1) |
Mir-582-v1
JH568145: 3349266-3349325 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-582-v2 JH568145: 3349267-3349324 [-] UCSC Ensembl |
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| Variant | Dno-Mir-582-v1 |
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| Seed | UACAGUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GACCUCCGCCCGUCAAUCUGUACUCUUUGGUUACAGUUGUUCAACCAGUUACUAAUCUAACUAAUUGUAACCGGUUGAACAACUGAACCCAAAGGGUGCAAAGUGGAAACAUUUCAUUGAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 GACCUCCGCCCGUCAAUC--| UUA A UAAUCU UGUACUCUUUGG CAGUUGUUCAACC GUUAC A ACGUGGGAAACC GUCAACAAGUUGG CAAUG A AGUUACUUUACAAAGGUGAA^ CAA C UUAAUC . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Dno-Mir-582-v1_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0047980 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UUACAGUUGUUCAACCAGUUAC -22
Get sequence
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| Star sequence | Dno-Mir-582-v1_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0047981 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
38- AACCGGUUGAACAACUGAACCC -60
Get sequence
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| Variant | Dno-Mir-582-v2 |
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| Seed | AACCGGU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
ACCUCCGCCCGUCAAUCUGUACUCUUUGGUUACAGUUGUUCAACCAGUUACUAAUCUAACUAAUUGUAACCGGUUGAACAACUGAACCCAAAGGGUGCAAAGUGGAAACAUUUCAUUGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 ACCUCCGCCCGUCAAUC--| UUA A UAAUCU UGUACUCUUUGG CAGUUGUUCAACC GUUAC A ACGUGGGAAACC GUCAACAAGUUGG CAAUG A GUUACUUUACAAAGGUGAA^ CAA C UUAAUC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dno-Mir-582-v2_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0047980 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UACAGUUGUUCAACCAGUUACU -22
Get sequence
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| Mature sequence | Dno-Mir-582-v2_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0047981 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
36- UAACCGGUUGAACAACUGAACC -58
Get sequence
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