| MirGeneDB ID | Cja-Mir-582 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-582 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | White-tufted-ear marmoset (Callithrix jacchus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-582-v1 Cfa-Mir-582-v1 Cpo-Mir-582-v1 Dno-Mir-582-v1 Eca-Mir-582 Hsa-Mir-582-v1 Laf-Mir-582-v1 Mml-Mir-582-v1 Mmr-Mir-582-v1 Mmu-Mir-582-v1 Ocu-Mir-582 Pab-Mir-582-v1 Rno-Mir-582-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_011100555.2_mCalJa1.2.pat.X_genomic) |
CM021916.1: 146882702-146882761 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UACAGUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GACCACAACAAGUCAGUCUGUGCUCUUUGAUUACAGUUGUUCAACCAGUUACUAAUCUAACUAAUUGUAACUGGUUGAACAACUGAACCCAAAGGGUGCAAAGUAGAAACAUUUCGUUGUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 GACCACAACAAGUCAGUC--| UG AUUA UAAUCU UG CUCUUUG CAGUUGUUCAACCAGUUAC A AC GGGAAAC GUCAACAAGUUGGUCAAUG A UGUUGCUUUACAAAGAUGAA^ GU CCAA UUAAUC . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Cja-Mir-582_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UUACAGUUGUUCAACCAGUUAC -22
Get sequence
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| Star sequence | Cja-Mir-582_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
38- AACUGGUUGAACAACUGAACCC -60
Get sequence
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