| MirGeneDB ID | Mml-Mir-582 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-582 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Rhesus monkey (Macaca mulatta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mml-mir-582 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-582-v1 Cfa-Mir-582-v1 Cja-Mir-582 Cpo-Mir-582-v1 Dno-Mir-582-v1 Eca-Mir-582 Hsa-Mir-582-v1 Laf-Mir-582-v1 Mmr-Mir-582-v1 Mmu-Mir-582-v1 Ocu-Mir-582 Pab-Mir-582-v1 Rno-Mir-582-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_003339765.3_Mmul_10_traces) |
CM014341.1: 58047909-58047968 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-582-v1) |
Mir-582-v1
CM014341.1: 58047909-58047968 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-582-v2 CM014341.1: 58047910-58047967 [-] UCSC Ensembl |
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| Variant | Mml-Mir-582-v1 |
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| Seed | UACAGUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GACCACAACAAGUCAAUCUGUGCUCUUUGAUUACAGUUGUUCAACCAGUUACUAAUCUACCUAAUUGUAACUGGUUGAACAACUGAACCCAAAGGGUGCAAAGUAGAAACAUUUCGUGAAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 GACCACAACAAGUCAAUC--| UG AUUA UAAUCU UG CUCUUUG CAGUUGUUCAACCAGUUAC A AC GGGAAAC GUCAACAAGUUGGUCAAUG C AAGUGCUUUACAAAGAUGAA^ GU CCAA UUAAUC . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mml-Mir-582-v1_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0006443 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UUACAGUUGUUCAACCAGUUAC -22
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-582-5p |
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| Co-mature sequence | Mml-Mir-582-v1_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0006444 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
38- AACUGGUUGAACAACUGAACCC -60
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-582-3p |
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| Variant | Mml-Mir-582-v2 |
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| Seed | ACAGUUG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
ACCACAACAAGUCAAUCUGUGCUCUUUGAUUACAGUUGUUCAACCAGUUACUAAUCUACCUAAUUGUAACUGGUUGAACAACUGAACCCAAAGGGUGCAAAGUAGAAACAUUUCGUGAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 ACCACAACAAGUCAAUC--| UG AUUA UAAUCU UG CUCUUUG CAGUUGUUCAACCAGUUAC A AC GGGAAAC GUCAACAAGUUGGUCAAUG C AGUGCUUUACAAAGAUGAA^ GU CCAA UUAAUC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mml-Mir-582-v2_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0006443 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UACAGUUGUUCAACCAGUUACU -22
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-582-5p |
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| Co-mature sequence | Mml-Mir-582-v2_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0006444 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
36- UAACUGGUUGAACAACUGAACC -58
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-582-3p |
