| MirGeneDB ID | Mmr-Mir-421-P1a | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-421 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Gray mouse lemur (Microcebus murinus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Mmr-Mir-421-P1b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-421-P1-v1 Cfa-Mir-421-P1-v1 Cpo-Mir-421-P1 Dno-Mir-421-P1-v1 Eca-Mir-421-P1-v1 Hsa-Mir-421-P1-v1 Mml-Mir-421-P1-v1 Ocu-Mir-421-P1-v1 Pab-Mir-421-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | M. murinus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_000165445.3_Mmur_3.0_genomic) |
CM007685.1: 9644879-9644941 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-421-P1a) |
Mir-421-P1a
CM007685.1: 9644879-9644941 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-421-P1b CM007685.1: 9645180-9645242 [-] UCSC Ensembl Mir-374-P1 CM007685.1: 9645350-9645401 [-] UCSC Ensembl |
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| Seed | CUCAGUA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CUCCAGAGCCCAGCCUGGCACAUUAGUAGGCCUCAGUAAAUGUUUAUUGGAUGAAUAAAUGAAUGACUCAUCAACAAACAUUUAUUGUGUGCCUGCUAAAGUGAUCUCCACGGGCUUUGGACUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 CUCCAGAGCCCAGCCUGG-- A CU-| AUUG AAUAAAU CAC UUAGUAGGC CAGUAAAUGUUU GAUG \ GUG AAUCGUCCG GUUAUUUACAAA CUAC G UCAGGUUUCGGGCACCUCUA A UGU^ CAA- UCAGUAA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mmr-Mir-421-P1a_5p (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CCUCAGUAAAUGUUUAUUGGAUG -23
Get sequence
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| Star sequence | Mmr-Mir-421-P1a_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- AUCAACAAACAUUUAUUGUGUGCC -63
Get sequence
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