| MirGeneDB ID | Mmr-Mir-374-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-374 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Gray mouse lemur (Microcebus murinus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmr-mir-374a | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-374-P1 Cfa-Mir-374-P1 Cja-Mir-374-P1 Cpo-Mir-374-P1 Dno-Mir-374-P1 Eca-Mir-374-P1 Hsa-Mir-374-P1 Mml-Mir-374-P1 Ocu-Mir-374-P1 Pab-Mir-374-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_000165445.3_Mmur_3.0_genomic) |
CM007685.1: 9645350-9645401 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-374-P1) |
Mir-421-P1a
CM007685.1: 9644879-9644941 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-421-P1b CM007685.1: 9645180-9645242 [-] UCSC Ensembl Mir-374-P1 CM007685.1: 9645350-9645401 [-] UCSC Ensembl |
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| Seed | UAUAAUA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
ACCCCCUGGAAGGAAAUUUUACAUCGGCCAUUAUAAUACAACCUGAUAAGUGUUUGAACACUUAUCAGAUUGUAUUGUAAUUGUCUGUGUAUAUAUGCCUGUCUCUCUUCCUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 ACCCCCUGGAAGGAAAUUU--| C C C UU UACAU GGC AUUAUAAUACAA CUGAUAAGUG U AUGUG CUG UAAUGUUAUGUU GACUAUUCAC G UCCUUCUCUCUGUCCGUAUAU^ U U A AA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mmr-Mir-374-P1_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0049164 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UUAUAAUACAACCUGAUAAGUG -22
Get sequence
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| Star sequence | Mmr-Mir-374-P1_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
30- CUUAUCAGAUUGUAUUGUAAUU -52
Get sequence
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