| MirGeneDB ID | Cja-Mir-374-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-374 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | White-tufted-ear marmoset (Callithrix jacchus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Cja-Mir-374-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-374-P1 Cfa-Mir-374-P1 Cpo-Mir-374-P1 Dno-Mir-374-P1 Eca-Mir-374-P1 Hsa-Mir-374-P1 Mml-Mir-374-P1 Mmr-Mir-374-P1 Ocu-Mir-374-P1 Pab-Mir-374-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_011100555.2_mCalJa1.2.pat.X_genomic) |
CM021937.1: 68734873-68734924 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UAUAAUA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AUCCCCUGGAAAGAAAUUUUACAUCGGCCAUUAUAAUACAACCUGAUAAGUGUUACAGCACUUAUCAGAUUGUAUUGUAAUUGUCUGUGUAUAUGCCUGUCUCUCUUCCUGUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 AUCCCCUGGAAAGAAAUUU--| C C C UU UACAU GGC AUUAUAAUACAA CUGAUAAGUG A AUGUG CUG UAAUGUUAUGUU GACUAUUCAC C UGUCCUUCUCUCUGUCCGUAU^ U U A GA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Cja-Mir-374-P1_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UUAUAAUACAACCUGAUAAGUG -22
Get sequence
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| Star sequence | Cja-Mir-374-P1_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
30- CUUAUCAGAUUGUAUUGUAAUU -52
Get sequence
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