| MirGeneDB ID | Dno-Mir-421-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-421 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Nine-banded armadillo (Dasypus novemcinctus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dno-mir-545 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-421-P1-v1 Cfa-Mir-421-P1-v1 Cpo-Mir-421-P1 Eca-Mir-421-P1-v1 Hsa-Mir-421-P1-v1 Mml-Mir-421-P1-v1 Mmr-Mir-421-P1a Mmr-Mir-421-P1b Ocu-Mir-421-P1-v1 Pab-Mir-421-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (dasNov3) |
JH568995: 131983-132043 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-421-P1-v1) |
Mir-421-P1-v1
JH568995: 131983-132043 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-421-P1-v2 JH568995: 131984-132042 [-] UCSC Ensembl Mir-374-P1 JH568995: 132148-132199 [-] UCSC Ensembl |
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| Variant | Dno-Mir-421-P1-v1 |
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| Seed | UGAGUAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UCCAGAGCCCAGCCUGGCACAUUAGUAGGCCUGAGUAAAUGUUUAUUGGAUGAAUAAAUGAAUGACUCAUCAACAAACAUUUAUUGUGUGCCUGCUAAAGUGAUCUCCACGGGCUCUGGACGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UCCAGAGCCCAGCCUGG-- A CUG-| AUUG AAUAAAU CAC UUAGUAGGC AGUAAAUGUUU GAUG \ GUG AAUCGUCCG UUAUUUACAAA CUAC G CAGGUCUCGGGCACCUCUA A UGUG^ CAA- UCAGUAA . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Dno-Mir-421-P1-v1_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0047973 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CUGAGUAAAUGUUUAUUGGAUG -22
Get sequence
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| Star sequence | Dno-Mir-421-P1-v1_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | MIMAT0047974 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- UCAACAAACAUUUAUUGUGUGC -61
Get sequence
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| Variant | Dno-Mir-421-P1-v2 |
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| Seed | GAGUAAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CCAGAGCCCAGCCUGGCACAUUAGUAGGCCUGAGUAAAUGUUUAUUGGAUGAAUAAAUGAAUGACUCAUCAACAAACAUUUAUUGUGUGCCUGCUAAAGUGAUCUCCACGGGCUCUGGAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CCAGAGCCCAGCCUGGC-- A CUG-| AUUG AUAAAU AC UUAGUAGGC AGUAAAUGUUU GAUGA \ UG AAUCGUCCG UUAUUUACAAA CUACU G AGGUCUCGGGCACCUCUAG A UGUG^ CAA- CAGUAA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Dno-Mir-421-P1-v2_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0047973 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UGAGUAAAUGUUUAUUGGAUGA -22
Get sequence
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| Star sequence | Dno-Mir-421-P1-v2_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | MIMAT0047974 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- AUCAACAAACAUUUAUUGUGUG -59
Get sequence
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