MirGeneDB ID | Mml-Mir-1298 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-1298 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Rhesus monkey (Macaca mulatta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | mml-mir-1298 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-1298 Cfa-Mir-1298 Cja-Mir-1298 Cpo-Mir-1298 Eca-Mir-1298 Ete-Mir-1298 Hsa-Mir-1298 Laf-Mir-1298 Mmr-Mir-1298 Mmu-Mir-1298 Ocu-Mir-1298 Pab-Mir-1298 Rno-Mir-1298 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_003339765.3_Mmul_10_traces) |
CM014356.1: 111265944-111266019 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-1298) |
Mir-1298
CM014356.1: 111265944-111266019 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-1911 CM014356.1: 111300398-111300456 [+] UCSC Ensembl |
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Seed | UCAUUCG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AGAGCUGUUGGAGAGACGAGGAGUUAAGAGUUCAUUCGGCUGUCCAGAUGUAUCCAAGUAUCCUCUGUUAUUUGGCAAUAAAUACAUCUGGGCAACUGACUGAACUUUUCGCUUUUCAUGACUCAGCUGGAACCCUGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 60 AGAGCUGUUGGAGAGAC--| U U C UCCAAGUAUCCUCU GAGGAGU AAGAGUUCA UCGG UGUCCAGAUGUA G CUUUUCG UUUUCAAGU AGUC ACGGGUCUACAU U UCCCAAGGUCGACUCAGUA^ C C A AAAUAACGGUUUAU 130 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Mml-Mir-1298_5p |
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mirBase accession | MIMAT0024316 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UUCAUUCGGCUGUCCAGAUGUA -22
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-1298-5p |
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Star sequence | Mml-Mir-1298_3p* |
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mirBase accession | MIMAT0027109 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
54- CAUCUGGGCAACUGACUGAACU -76
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-1298-3p |