MirGeneDB ID | Mdo-Mir-7262-P5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-7262 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Gray short-tailed opossum (Monodelphis domestica) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Mdo-Mir-7262-P1 Mdo-Mir-7262-P2 Mdo-Mir-7262-P3 Mdo-Mir-7262-P4 Mdo-Mir-7262-P6 Mdo-Mir-7262-P7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Sha-Mir-7262-P5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Marsupialia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Marsupialia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (monDom5_add) |
4: 320770574-320770632 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AACUGCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CACACACACACACACACUCUUACAAUAUCUCAAAAGACUUGAAGCAAUUUUAAGCUAUUAAAGCUUAAAACUGCUUUAAGACUUUUAGGAUAUCUUCUUUAUCACUAUAUGUAAAUAUGGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 CACACACACACACACACUCUUACA--| UC A A AGCUAU AUAUC AAAAG CUUGAAGCA UUUUA \ UAUAG UUUUC GAAUUUCGU AAAAU U GUAUAAAUGUAUAUCACUAUUUCUUC^ GA A C UCGAAA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Mdo-Mir-7262-P5_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CAAAAGACUUGAAGCAAUUUUA -22
Get sequence
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Mature sequence | Mdo-Mir-7262-P5_3p (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
37- AAACUGCUUUAAGACUUUUAGG -59
Get sequence
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