| MirGeneDB ID | Mdo-Mir-7262-P3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-7262 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Gray short-tailed opossum (Monodelphis domestica) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Mdo-Mir-7262-P1 Mdo-Mir-7262-P2 Mdo-Mir-7262-P4 Mdo-Mir-7262-P5 Mdo-Mir-7262-P6 Mdo-Mir-7262-P7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Sha-Mir-7262-P3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Marsupialia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Marsupialia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (monDom5_add) |
1: 195829696-195829754 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AACUGCA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UAAGUCCUGCCUCUAAUAUGCAGAAUGUUUCCAAAGUCUCAGUGCAGCUUUAAAUUAUUGAAGCUUAAAACUGCACUAAGACUUUUGAGAUUCUUUUUAUACUAGUUGUGUGACCCUGGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UAAGUCCUGCCUCUAAU--| C AU C C C AAUUAU AUG AGA GUUUC AAAGUCU AGUGCAG UUUA \ UAU UUU UAGAG UUUCAGA UCACGUC AAAU U GGUCCCAGUGUGUUGAUCA^ U CU U A A UCGAAG 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Mdo-Mir-7262-P3_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CCAAAGUCUCAGUGCAGCUUUA -22
Get sequence
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| Mature sequence | Mdo-Mir-7262-P3_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- AAACUGCACUAAGACUUUUGAG -59
Get sequence
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