| MirGeneDB ID | Mal-Mir-2184-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-2184 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Asian swamp eel (Monopterus albus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Mal-Mir-2184-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Ami-Mir-2184 Cpi-Mir-2184 Dre-Mir-2184-P1a Dre-Mir-2184-P1b Gga-Mir-2184 Gmo-Mir-2184 Lch-Mir-2184 Loc-Mir-2184 Mun-Mir-2184 Tni-Mir-2184-P1 Xtr-Mir-2184 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Clupeocephala | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_001952655.1_M_albus_1.0_genomic) |
KV884887.1: 551809-551866 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-2184-P1) |
Mir-132-P2b
KV884887.1: 549978-550045 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-132-P1b KV884887.1: 550376-550437 [+] UCSC Ensembl Mir-2184-P1 KV884887.1: 551809-551866 [-] UCSC Ensembl |
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| Seed | ACAGUAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UGUGUGUCAGAGAAUUACUUCUCAGCCCUGAACAGUAAGAGUUUAUGUGCUGUUGUCUACCUGUCAGCACAUGAGCUUUUACGGUGCAGGGAGGCAGAGGAUAAACAUCUUUCUUUGCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UGUGUGUCAGAGAAUUA- CAG-| A A UUGUC CUUCU CCCUG AC GUAAGAGUUUAUGUGCUG U GGAGA GGGAC UG CAUUUUCGAGUACACGAC A CGUUUCUUUCUACAAAUA CGGA^ G G UGUCC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mal-Mir-2184-P1_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AACAGUAAGAGUUUAUGUGCUG -22
Get sequence
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| Star sequence | Mal-Mir-2184-P1_3p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
36- GCACAUGAGCUUUUACGGUGCA -58
Get sequence
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