| MirGeneDB ID | Lpo-Mir-153-P15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-153 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UGCAUAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Atlantic horseshoe crab (Limulus polyphemus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Lpo-Mir-153-P10 Lpo-Mir-153-P11 Lpo-Mir-153-P12 Lpo-Mir-153-P13 Lpo-Mir-153-P14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Asu-Mir-153 Bfl-Mir-153 Bla-Mir-153 Bpl-Mir-153 Cgi-Mir-153 Cin-Mir-153 Cte-Mir-153 Dma-Mir-153 Dpu-Mir-153 Isc-Mir-153 Lan-Mir-153 Lgi-Mir-153 Npo-Mir-153 Obi-Mir-153 Ovu-Mir-153 Pfl-Mir-153 Pmi-Mir-153 Sko-Mir-153 Sme-Mir-153 Spu-Mir-153 Xbo-Mir-153 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | L. polyphemus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCF_000517525.1_Limulus_polyphemus-2.1.2_genomic) |
NW_013667366.1: 252182-252238 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CUGGUGGUCUUCAUCGUCCUUUUUCGCCAAUCAUUUUUGUGAUGAGUGCAAUUUGUCUUUUUUAAUUGCAUAGUCGCAAAAGUGAUGGGUAGAGUUGGACAACACAUCAUUACAUCUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 CUGGUGGUCUUCAUCGU--| UU CG A GA UGUC CC UUU CC AUCAUUUUUGUGAU GUGCAAUU U GG GAG GG UAGUGAAAACGCUG UACGUUAA U UCUACAUUACUACACAACA^ UU AU G A- UUUU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17), UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Lpo-Mir-153-P15_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UCAUUUUUGUGAUGAGUGCAAUU -23
Get sequence
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| Mature sequence | Lpo-Mir-153-P15_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
35- UUGCAUAGUCGCAAAAGUGAUG -57
Get sequence
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