| MirGeneDB ID | Ebu-Mir-153-P6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-153 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UGCAUAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Inshore hagfish (Eptatretus burgeri) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Ebu-Mir-153-P5 Ebu-Mir-153-P7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Asu-Mir-153 Bfl-Mir-153 Bla-Mir-153 Bpl-Mir-153 Cgi-Mir-153 Cin-Mir-153 Cte-Mir-153 Dma-Mir-153 Dpu-Mir-153 Isc-Mir-153 Lan-Mir-153 Lgi-Mir-153 Npo-Mir-153 Obi-Mir-153 Ovu-Mir-153 Pfl-Mir-153 Pmi-Mir-153 Sko-Mir-153 Sme-Mir-153 Spu-Mir-153 Xbo-Mir-153 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | E. burgeri | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Eburgeri_3) |
FYBX02010558.1: 199410-199470 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GCACUCGUCGUGCCAAGAUGGCUGCCGCUAUCAUUUUUGUGAUUUGCAGCUUGAUCAUUCCAAAUACAGUUGCAUAGUCACAAAAGUGAUUAUCGGAAUCUGUCGUUGCCACCACAGACCUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50
GCACUCGUCGUGCCAAG- CUG CU- -| UGAUCAU
AUGG CCG AUCAUUUUUGUGAUU UGCAGCU U
UGUC GGC UAGUGAAAACACUGA ACGUUGA C
UCCAGACACCACCGUUGC UAA UAU U^ CAUAAAC
. 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Ebu-Mir-153-P6_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UCAUUUUUGUGAUUUGCAGCU -21
Get sequence
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| Mature sequence | Ebu-Mir-153-P6_3p (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- UUGCAUAGUCACAAAAGUGAUU -61
Get sequence
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