MirGeneDB ID | Dya-Mir-977 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-977 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Fruit fly (Drosophila yakuba) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | dya-mir-977 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Dan-Mir-977 Dme-Mir-977 Dmo-Mir-977 Dsi-Mir-977 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Drosophila | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Drosophila | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Drosophila_yakuba.dyak_caf1.dna.toplevel) |
X: 11885660-11885723 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-977) |
Mir-978
X: 11883774-11883834 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-977 X: 11885660-11885723 [-] UCSC Ensembl Mir-976 X: 11885829-11885886 [-] UCSC Ensembl Mir-975 X: 11885984-11886046 [-] UCSC Ensembl Mir-9690 X: 11886163-11886224 [-] UCSC Ensembl |
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Seed | GAGAUAU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
ACAGCUCAGAGUUCACCCCAAGGUAUGGCCUAGAUAACACGGGUAUCACAUCUUUAUGCAUUCGAUAUCUGGUGAGAUAUUCACGUUGUCUAAACCAUGUUUUGUAAGGAAAUGCACUCUGCUCGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 60 ACAGCUCAGAGUUCACCC--| GG CC AC A UUUAUGCA CAA UAUGG UAGAUAAC GGGUAUC CAUC U GUU GUACC AUCUGUUG CUUAUAG GUGG U CUCGUCUCACGUAAAGGAAU^ UU AA CA A UCUAUAGC 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Dya-Mir-977_5p* (predicted) |
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mirBase accession | MIMAT0039186 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UAGAUAACACGGGUAUCACAUC -22
Get sequence
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Mature sequence | Dya-Mir-977_3p (predicted) |
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mirBase accession | MIMAT0039187 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
42- UGAGAUAUUCACGUUGUCUAAA -64
Get sequence
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