MirGeneDB ID | Dya-Mir-9690 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-9690 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Fruit fly (Drosophila yakuba) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | dya-mir-9690 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | D. yakuba | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | D. yakuba | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Drosophila_yakuba.dyak_caf1.dna.toplevel) |
X: 11886163-11886224 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-9690) |
Mir-978
X: 11883774-11883834 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-977 X: 11885660-11885723 [-] UCSC Ensembl Mir-976 X: 11885829-11885886 [-] UCSC Ensembl Mir-975 X: 11885984-11886046 [-] UCSC Ensembl Mir-9690 X: 11886163-11886224 [-] UCSC Ensembl |
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Seed | AUACGAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GAAAGAAGUCAUCUUGGUAUUAUGGCAACAAGUUUCCGGGACUUCGUACUGUAUGACAGACUAUAUAUACAAUACGAAGCCUCUGAAAUUUUCUGCGCUCAAGUACCAAAAACUACCAGCAAGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 60 GAAAGAAGUCAUCUUGGUAUUAUG--| AC C A C AUGACAG GCA AAGUUUC GGG CUUCGUA UGU A CGU UUUAAAG CUC GAAGCAU ACA C AACGACCAUCAAAAACCAUGAACUCG^ CU U C A UAUAUAU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Dya-Mir-9690_5p* |
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mirBase accession | MIMAT0039184 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AGUUUCCGGGACUUCGUACUGU -22
Get sequence
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Mature sequence | Dya-Mir-9690_3p |
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mirBase accession | MIMAT0039185 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
40- AAUACGAAGCCUCUGAAAUUUU -62
Get sequence
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