| MirGeneDB ID | Dya-Mir-975 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-975 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Fruit fly (Drosophila yakuba) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dya-mir-975 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Dan-Mir-975 Dme-Mir-975 Dmo-Mir-975 Dsi-Mir-975 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Drosophila | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Drosophila | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Drosophila_yakuba.dyak_caf1.dna.toplevel) |
X: 11885984-11886046 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-975) |
Mir-978
X: 11883774-11883834 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-977 X: 11885660-11885723 [-] UCSC Ensembl Mir-976 X: 11885829-11885886 [-] UCSC Ensembl Mir-975 X: 11885984-11886046 [-] UCSC Ensembl Mir-9690 X: 11886163-11886224 [-] UCSC Ensembl |
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| Seed | UAAACAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
ACAAUAUCCAGCAAUAUUGAAUUCUUGACUUUAAACACUGCCUACAUACUGUAUGUGUUUUGCACCCGAUACAGAUGUGGGGGUCGUUUGCAAUCAGAGAUUCCGCAGGCUACGAGGAUCGGGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 ACAAUAUCCAGCAAUAUU-- UC CUU -| G A UGUGUUU GAAU UUGA UAAAC ACU CCUACAU CUGUA U CUUA GACU GUUUG UGG GGGUGUA GACAU G GGGCUAGGAGCAUCGGACGC GA AAC C^ - - AGCCCAC 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17), UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Dya-Mir-975_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0039177 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UUAAACACUGCCUACAUACUGUA -23
Get sequence
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| Star sequence | Dya-Mir-975_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | MIMAT0039178 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
41- CAGAUGUGGGGGUCGUUUGCAA -63
Get sequence
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