| MirGeneDB ID | Dno-Mir-3613 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-3613 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Nine-banded armadillo (Dasypus novemcinctus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dno-mir-3613 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-3613 Cfa-Mir-3613 Cja-Mir-3613 Cpo-Mir-3613 Eca-Mir-3613 Ete-Mir-3613 Hsa-Mir-3613 Laf-Mir-3613 Mdo-Mir-3613 Mml-Mir-3613 Mmr-Mir-3613 Neu-Mir-3613 Ocu-Mir-3613 Pab-Mir-3613 Sha-Mir-3613 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Theria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Theria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (dasNov3) |
JH570793: 688270-688328 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-3613) |
Mir-3613
JH570793: 688270-688328 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-15-P2a JH570793: 729350-729414 [-] UCSC Ensembl Mir-15-P1a JH570793: 729493-729551 [-] UCSC Ensembl |
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| Seed | GUUGUAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UGACGCUCAAUAAGAUCGUUGGGUUUGGAUUGUUGUACUUUUUUUUUUGUUCGUUCAAUUUUUAGGAACAAAAAAAAAAGCCCAACCCUUCACACCACUUCACCGGCAUCCAGACGAGCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UGACGCUCAAUAAGAUCGUUG--| U UU UA GUUCAA GGU UGGA GUUG CUUUUUUUUUUGUUC \ CCA ACUU CAAC GAAAAAAAAAACAAG U CGAGCAGACCUACGGCCACUUCA^ C CC CC GAUUUU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Dno-Mir-3613_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0048063 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UGUUGUACUUUUUUUUUUGUUC -22
Get sequence
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| Star sequence | Dno-Mir-3613_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0048064 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- ACAAAAAAAAAAGCCCAACCCU -59
Get sequence
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